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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-10-3 15:32:22 | 只看该作者 Only view this author
dingniu2 发表于 2015-10-3 11:51
请问对于def2-TZVP基组,什么情况下可以用阉割版def2-TZVP(-f),什么情况下必须用完整版def2-TZVP呢?这 ...

最主要的是看方法
对于后HF,不应当阉割。因为后HF方法对极化函数敏感,极化函数不够性能不好。
对于DFT(双杂化除外),阉割没问题。

另外,计算几何结构、电荷,这样的任务对基组要求低,即便是后HF,阉割也比较safe
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2015-10-3 16:41:12 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-10-3 15:32
最主要的是看方法
对于后HF,不应当阉割。因为后HF方法对极化函数敏感,极化函数不够性能不好。
对于DF ...

多谢sob老师。还有一个问题,对中等大小弱相互作用体系,与B3LYP-D3相比,采用BLYP-D3泛函在几何结构上可能影响不大,但电荷、能量以及其它性质上会不会有大的差异?以及体系有无过渡金属在B3LYP与BLYP之间的选择有无影响?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-10-3 17:43:08 | 只看该作者 Only view this author
dingniu2 发表于 2015-10-3 16:41
多谢sob老师。还有一个问题,对中等大小弱相互作用体系,与B3LYP-D3相比,采用BLYP-D3泛函在几何结构上可 ...


电荷不会有多大差异。
至于能量,你若考查的是弱相互作用能,那也不会有太大差异。
对于研究含过渡金属的弱相互作用问题,用这两个也都可以。
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发表于 Post on 2015-10-4 22:58:59 | 只看该作者 Only view this author
请教各位老师一个问题:柔性扫描的时候,每scan一步出来的结果是不是已经都是优化完的?假如已经在扫描的范围内找到了最小值,此能量最小的结构还用不用再优化了?
淡泊以明志,宁静以致远。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-10-5 03:22:27 | 只看该作者 Only view this author
978142355 发表于 2015-10-4 22:58
请教各位老师一个问题:柔性扫描的时候,每scan一步出来的结果是不是已经都是优化完的?假如已经在扫描的范 ...

每一步都是限制性优化完的。
扫描曲线上找到了最小值点也还得再做全优化。因为毕竟你扫的那个变量是有一定步长的,除非个别情况,不会恰好某个扫描点正好落在全优化的时候那个变量的数值上。
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发表于 Post on 2015-10-5 08:13:37 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-10-5 03:22
每一步都是限制性优化完的。
扫描曲线上找到了最小值点也还得再做全优化。因为毕竟你扫的那个变量是有一 ...

谢谢sob老师的答疑解惑。
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发表于 Post on 2015-10-6 12:56:34 | 只看该作者 Only view this author
“一般来讲,势垒小于21kcal/mol就可以在室温下发生。”

请问sob老师,这个是否可以有文献引用啊,我现在有一个数据可以用这个解释

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-10-6 13:45:44 | 只看该作者 Only view this author
fankui1990129 发表于 2015-10-6 12:56
“一般来讲,势垒小于21kcal/mol就可以在室温下发生。”

请问sob老师,这个是否可以有文献引用啊,我现 ...

Computational Chemistry: A Practical Guide for Applying Techniques to Real-World Problems第17.1节开头
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发表于 Post on 2015-10-8 08:43:09 | 只看该作者 Only view this author
请问sob老师,体系以纯泛函优化后,要做波函数分析(AIM,RDG,homo-lumo,DOS,静电势等),是否需要用杂化泛函再算单点得到新波函数?
对于某些性质,直接以纯泛函得到的波函数是否不如杂化泛函的准确?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-10-8 08:56:41 | 只看该作者 Only view this author
dingniu2 发表于 2015-10-8 08:43
请问sob老师,体系以纯泛函优化后,要做波函数分析(AIM,RDG,homo-lumo,DOS,静电势等),是否需要用杂 ...

AIM、RDG、静电势这些,对于泛函的选择不敏感,纯泛函完全没问题。
HOMO-LUMO gap、以及牵扯到能级分布的DOS,对于泛函的选择是敏感的,最好用杂化泛函。
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发表于 Post on 2015-10-8 09:37:08 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-10-8 08:56
AIM、RDG、静电势这些,对于泛函的选择不敏感,纯泛函完全没问题。
HOMO-LUMO gap、以及牵扯到能级分布 ...

多谢sob老师,还有一个问题,做布局分析homo,lumo等轨道时,是用软件自带的mulliken布居方法,还是用NBO程序产生的布居分析homo,lumo等?两者有区别吗?两者哪个认可度高? 谢谢!!!!!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-10-8 10:27:45 | 只看该作者 Only view this author
dingniu2 发表于 2015-10-8 09:37
多谢sob老师,还有一个问题,做布局分析homo,lumo等轨道时,是用软件自带的mulliken布居方法,还是用 ...

你是指考察轨道成份?考察轨道成份的话看此文:
谈谈轨道成份的计算方法
http://sobereva.com/131
分子轨道成分的计算.pdf (805.59 KB, 下载次数 Times of downloads: 67)

轨道成份乘上轨道占据数就是轨道中的布居数。
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发表于 Post on 2015-10-8 11:13:54 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-10-8 10:27
你是指考察轨道成份?考察轨道成份的话看此文:
谈谈轨道成份的计算方法
http://sobereva.com/131

多谢sob老师!!!!

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发表于 Post on 2015-10-15 14:19:27 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 mmjjmmjj 于 2015-10-15 14:22 编辑

求关于电子组态命名规则的介绍书或者文章。带有详尽的例子更好!
谢谢!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-10-15 14:42:08 | 只看该作者 Only view this author
mmjjmmjj 发表于 2015-10-15 14:19
求关于电子组态命名规则的介绍书或者文章。带有详尽的例子更好!
谢谢!


levine的quantum chemistry里就有介绍。
如果对于不可约表示符号搞不清楚,建议看看cotton的群论在化学中的应用
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