计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
楼主 Author: sky
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[VASP] vasp做过渡态经验<二>:Dimer

  [复制链接 Copy URL]

14

帖子

0

威望

263

eV
积分
277

Level 3 能力者

76#
发表于 Post on 2025-2-10 20:31:05 | 只看该作者 Only view this author
小徐不激动 发表于 2023-6-7 13:54
求助,为什么我点开链接之后没有上面所说的脚本

有的脚本名字不一样

63

帖子

0

威望

1062

eV
积分
1125

Level 4 (黑子)

77#
发表于 Post on 2025-3-3 10:41:57 | 只看该作者 Only view this author
DavyHou 发表于 2017-12-26 21:55
Dimer_test$ python imagefreq.py
imagefreq.py:26: Warning: 'with' will become a reserved keyword in ...

您好,请问在做过渡态搜索的时候能否只是用dimer,因为我做的大体系跑CI-NEB实在是太慢了;使用dimer跑出来的过渡态有且仅有一个虚频并且虚频振动方向是反应物和产物之间,这个过渡态结果能否直接使用呢

59

帖子

0

威望

4565

eV
积分
4624

Level 6 (一方通行)

78#
发表于 Post on 2025-3-5 09:28:17 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 DavyHou 于 2025-3-5 09:37 编辑
CHLllooll 发表于 2025-3-3 10:41
您好,请问在做过渡态搜索的时候能否只是用dimer,因为我做的大体系跑CI-NEB实在是太慢了;使用dimer跑出 ...

如果你的始、终结构比较简单的话可以。如果始、终结构差距比较大的话可能有问题。因为在用CI-NEB计算时,有可能发现局域最小值,将一步反应转换为两步甚至多步反应,这样就有多个过渡态。对于复杂体系,只用dimer计算的话,可能只发现其中的一个过渡态。对于大体系,推荐使用低精度跑CI-NEB,确保能量曲线类似于开口向下的二次曲线而不是M形状后再跑dimer。

1

帖子

0

威望

172

eV
积分
173

Level 3 能力者

79#
发表于 Post on 2025-3-17 18:20:11 | 只看该作者 Only view this author
DFT搬砖工 发表于 2020-6-25 12:08
**** 作者被禁止或删除 内容自动屏蔽 ****

您好,遇到了和您一样的报错,请问解决了吗

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-14 09:18 , Processed in 0.229589 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list