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计算化学公社»论坛首页 › 理论与计算化学 (Theoretical and Computational Chemistry) › 分子模拟 (Molecular Modeling) › LigParGen生成OPLS-AA拓扑文件问题
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[综合交流] LigParGen生成OPLS-AA拓扑文件问题

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nxh9681

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发表于 Post on 2018-4-9 19:14:58 | 只看该作者 Only view this author |只看大图 View big picture 回帖奖励 |倒序浏览 Reverse view |阅读模式 Reading model
想在LigParGen里生成LAMMPS的OPLS-AA拓扑文件，输入的源文件为".mol"格式的。但是LigParGen输出的构型和输入构型完全不一致，输入结构和输出结构分别如图所示，请问这是什么原因呢？

输入结构.jpg (33.86 KB, 下载次数 Times of downloads: 17)

输入结构

输入结构

输出结构.jpg (45.31 KB, 下载次数 Times of downloads: 14)

输出结构

输出结构
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