MS dmol3 过渡态搜索问题

wangxinmin · 发表于 Post on 2017-12-8 09:51:51

过渡态搜索进行模拟中，同样的参数设定，有的可以模拟成功，有的就是任务失败，不知道什么原因，是反应物和生成物不合理还是别的原因不太清楚，有哪位大神可以帮助一下。拜托》

zyj19831206 · 发表于 Post on 2017-12-8 10:27:14

没有例子没有真相。

wangxinmin · 发表于 Post on 2017-12-8 11:21:36

这是我的参数设定，和模拟所得到的图像，还有错误的地方，以前参数也是这么设定的能算出来，但是现在算的就会有错误，不知道怎么改，麻烦您看一下，谢谢

lwj · 发表于 Post on 2017-12-9 18:32:22

wangxinmin 发表于 2017-12-8 11:21
这是我的参数设定，和模拟所得到的图像，还有错误的地方，以前参数也是这么设定的能算出来，但是现在算 ...

可能你的初始结构或者产物结构不合适，如果可以，看一下还有没有其他的结构，换一下试一试比这个更好

wangxinmin · 发表于 Post on 2017-12-9 18:57:41

lwj 发表于 2017-12-9 18:32
可能你的初始结构或者产物结构不合适，如果可以，看一下还有没有其他的结构，换一下试一试比这个更好

好的，我试一试换一下别的结构，谢谢

卡开发发 · 发表于 Post on 2017-12-9 19:13:27

wangxinmin 发表于 2017-12-9 18:57
好的，我试一试换一下别的结构，谢谢

LST的过程都能看出来路径上有其他极小点，显然路径的设计就不太合理。试试看单独把0.6附近那个结构单独拿出来优化看看，然后再分别构造路径。

wangxinmin · 发表于 Post on 2017-12-9 19:58:39

老师，模拟完成，然后进行振动分析得到这种结果有问题吗？在附件里边是截取是我结果，麻烦您看一下。

sobereva · 发表于 Post on 2017-12-9 22:12:10

wangxinmin 发表于 2017-12-9 19:58
老师，模拟完成，然后进行振动分析得到这种结果有问题吗？在附件里边是截取是我结果，麻烦您看一下。

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