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楼主 Author: lmwnbpes
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[CASTEP/Dmol3/MS] Dmol3算铀掺杂石墨烯结构优化出现问题

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发表于 Post on 2015-1-22 08:44:16 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 卡开发发 于 2015-1-22 08:45 编辑

我做了测试,取了6x6的表面(不知道什么原因,小于6x6超胞我测试了能带结构,无论k取多大给出的结果都有点问题),做了a=b=14.74~14.83A的测试,拟合抛物线内插得到晶格常数的能量极小点为a=b=14.793,真空层我取了30A。

在默认Fine精度的基准上修改了k、smearing,k为11x11x1,这个在先前的帖子中做了测试,smearing降低到0.001Ha(约0.03eV,其实也可以不用)。

截断半径取全局为5.9A,我做了测试,如果只有U取5.9,C取4.5,可能导致力不收敛,以往的经验来说也不推荐取不同的截断半径,有时候可能造成scf不收敛,有时候可能造成结构弛豫不收敛等问题。因为截断半径和k都很大,可能计算速度稍慢些,12核心服务器预计0.8~1.5m做一次scf。

另外,你的初始结构O原子指向比较糟糕。

我把以及优化好的U-graphite和O@U-graphite的结构做成cif(避免版本差异)放在这,你可以参考这个结构做一些后续处理。

O@U-G.cif

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氧吸附

U-G.cif

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掺杂

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-1-26 09:30:36 | 只看该作者 Only view this author
卡开发发 发表于 2015-1-22 08:44
我做了测试,取了6x6的表面(不知道什么原因,小于6x6超胞我测试了能带结构,无论k取多大给出的结果都有点 ...

非常感谢您的详细解答,学到很多。
我想问一下  我尝试把Max.step size从0.3  调到0.1 ,就收敛了,这个怎么理解

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发表于 Post on 2015-1-26 09:55:48 | 只看该作者 Only view this author
是说每次跳.3 正好错过了能量最低点吗? 猜的

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发表于 Post on 2015-1-26 13:35:18 | 只看该作者 Only view this author
lmwnbpes 发表于 2015-1-26 09:30
非常感谢您的详细解答,学到很多。
我想问一下  我尝试把Max.step size从0.3  调到0.1 ,就收敛了,这 ...

结构振荡比较严重的情况可以限制分配的下一步原子移动,这样每次计算能量和力之后分配出各个原子的移动即便大于0.1A也按照0.1A进行移动,有时候比较管用。不过一般不建议这个值设定的太小。
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