pull跨膜发现膜逐渐断裂

zongshu

通过npt pull跨膜，发现膜逐渐断裂.以下是我的模拟代码
pcoupl              =  berendsen   ; Pressure coupling on in NPTberendsen
pcoupltype          = semiisotropic            
tau_p               = 2.0                   ; time constant, in ps
ref_p               = 1.0       1.0         ; reference pressure, in bar
compressibility     = 0     4.5e-5   

pull_ncoords             = 1

pull_ngroups             = 2

pull_group1_name         = PA_PC

pull_group2_name         = MOL

pull_coord1_type         = umbrella

pull_coord1_geometry     = distance

pull_coord1_groups       = 1 2

pull_coord1_dim          = N N Y

pull_coord1_vec         = 0.0 0.0 1.0  

pull_coord1_rate         = 0.02      ; 每 ps 向下移动 0.02 nm

pull_coord1_k            = 1000      ; kJ mol⁻¹ nm⁻²，力常数

pull_coord1_start        = yes

pull                     = yes

KazusaT

膜逐渐断裂是什么意思？你是指像图片里这样膜分层了？