VASP的GPU加速硬件配置方案

jiangning198511 · 发表于 Post on 2017-3-10 15:27:05

今天参加了VASP的GPU加速硬件配置方案视频讲座，从测试结果来看VASP GPU加速有一些优势，附件中是报告PPT，有兴趣的同学可以看看

PS: 报告中提到VASP购买信息的真实性请大家自行判断。
PPS: VASP官网上有这样一句话，请大家注意！！！
Please note that Hongcam and its subsidiaries are no longer distributor and not authorized to sell or support MedeA®or VASP.

sobereva · 发表于 Post on 2017-3-10 15:34:12

看完我的态度是“呵呵”
直接找官方买就完了。从国内代理买，源*也更名正言顺

jiangning198511 · 发表于 Post on 2017-3-10 15:37:38

sobereva 发表于 2017-3-10 15:34
看完我的态度是“呵呵”
直接找官方买就完了。从国内代理买，源*也更名正言顺

如果国内能直接报销的话，估计代理公司就没戏唱了

lisu555 · 发表于 Post on 2017-3-10 17:01:34

代理商不可靠啊，这么便宜？！

szp12345 · 发表于 Post on 2017-3-14 09:41:08

我始终有个问题，GPU版VASP是靠显卡的单精度浮点运算还是双精度浮点运算？换句话说，用游戏卡和专业计算卡计算哪个更合适？请高人指点？

sobereva · 发表于 Post on 2017-3-14 18:52:29

szp12345 发表于 2017-3-14 09:41
我始终有个问题，GPU版VASP是靠显卡的单精度浮点运算还是双精度浮点运算？换句话说，用游戏卡和专业计算卡 ...

从测试上看走的是单精度，毕竟1080双精度弱爆

szp12345 · 发表于 Post on 2017-3-14 20:23:01

sobereva 发表于 2017-3-14 18:52
从测试上看走的是单精度，毕竟1080双精度弱爆

哦，那其实完全没必要上专业计算卡，多谢指点

auroraustc · 发表于 Post on 2017-10-26 11:28:09

本帖最后由 auroraustc 于 2017-10-26 11:34 编辑

sobereva 发表于 2017-3-14 18:52
从测试上看走的是单精度，毕竟1080双精度弱爆

您好，我认为您的看法不完全正确，vasp_gpu应该主要为双精度运算，理由如下：
1、单精度计算的有效数字位数对于VASP而言应该是不够的。用cuBLAS
库中的sgemm连续作两次1024*1024的矩阵相乘（就是3个矩阵相乘），其计算结果和CPU端的结果就已经会有1*10E-6的误差，这至少对于VASP的EDIFF收敛是不可接受的（GPU版VASP主要是把电子步的Blocked-Davidson和RMM-DIIS进行GPU化了）。
2、对VASP源码中src/CUDA/文件夹下的文件进行grep，比如grep "Dgemm"之类的操作，得到的结果显示双精度函数的使用远多于单精度函数，就比如矩阵相乘，Dgemm/Zgemm的使用远多于Sgemm。
3、对于附件中的计算结果，也是容易解释的。我在2*E5 2680v3上测试双精度的运算性能，大约在350~400Gflops（使用Intel MKL）；wiki上查到GTX1080单卡的双精度性能是257Gflops，所以2*1080+2*2650的效率估计会在2*2650的2.5~3.5倍，和附件的结果结论类似。
4、对于个人的测试，测试平台是ryzen 1700（用Intel MKL和Intel Fortran。ryzen的双精度浮点运算还行，8核全开大约在e5 2670的1.3~1.5倍左右，还是打不过双路2670的服务器）+GTX Titan（老泰坦，双精度1300Gflops左右，在驱动中打开双精度），比较ryzen 1700四核和ryzen 1700四核+Titan的结果，对于较小的体系（十几个原子）加速效果并不明显，大约在1.5~3倍左右；对于较大的体系（35个原子以上；同时可以强行修改一下KPOINTS增大计算量）有接近10倍的加速。附件中没有说明测试体系，个人觉得使用4*k80完全被浪费了，考虑到，说不定1*k80的计算时间也差不多是这么多。
5、对于4的补充，测试机器是双通道的，根据测试发现对于ryzen 1700，每通道2个核的时间/核心比每通道4个核的时间/核心小很多。换句话说，单通道+4核运算速度不如双通道+4核；双通道+8和的运算速度比双通道+4核快得很有限。可能和ryzen的内存控制器有关吧，毕竟不是服务器cpu。
6、对于3的补充。3的结果其实比较迷，我还在笔记本的i7 4700hq和ryzen 1700分别用dgemm函数做过测试，4核4700hq的双精度在60Gflops左右，8核ryzen 1700的双精度效率才略高于70Gflops。不知是Intel MKL的问题还是ryzen的浮点本来就这个样。但是测试VASP发现8核ryzen 1700还是比8核e5 2670要快一点，比4700hq快2倍不止。

搞理论的 · 发表于 Post on 2019-8-29 21:39:55

auroraustc 发表于 2017-10-26 11:28
您好，我认为您的看法不完全正确，vasp_gpu应该主要为双精度运算，理由如下：
1、单精度计算的有效数字 ...

所以做VASP计算的话，您认为是GTX1080，GTX2060这样的游戏卡效果更好，还是K40，K80这样的卡更好？

jugengfans · 发表于 Post on 2020-7-15 18:26:25

求教一下，目前单位用的5.4.4版，那么请问vasp GPU版需要单独购买吗？多少钱？

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