求助键角统计，一定时间内表面H2O分子中O-H向量与催化剂表面法向之间的点积

billcsu

本人做的是催化剂界面溶剂分子动力学模拟，想要统计在一定时间内表面H2O分子中O-H向量与催化剂表面法向之间的点积，这个不知道VMD是否可以实现，请教大神老师，是否曾经有过这样的脚本呢，因为我看大量的文献经常都在用这种处理方法，可能都是自己写的脚本吧，但是我自己写起来还是很困难。望不吝赐教！！

对抗路达摩

VMD肯定可以写的，我自己更习惯于用python和MDAnalysis，python结合numpy、matplotlib等python生态，处理起数据很方便。
具体怎么做现在问AI就行了，问的时候提示词要讲清楚自己要算什么，用什么做模拟的，想得到什么结果。