gmx_MMPBSA_ana根据MMPBSA计算结果绘制柱状图问题

12313 · 发表于 Post on 2024-9-24 19:18:56

本帖最后由 12313 于 2024-9-24 19:20 编辑

各位老师好，我的体系是蛋白-多肽复合物体系，在使用gmx_MMPBSA进行氨基酸自由能分解计算后，使用gmx_MMPBSA_ana对计算结果进行可视化处理，第一张图是我的氨基酸残基自由能分解图，第二张图是文献的，我的问题是，第一，该如何像文献一样，横坐标只有氨基酸残基名称及编号，而没有第一张图中ChainA和ChainB的标注。第二，如何只针对某些氨基酸残基对应的能量柱状图，进行颜色的修改，比如我想将ChainA和ChainB的氨基酸残基能量柱状图用不同的颜色标注。感谢各位老师

Loading0760 · 发表于 Post on 2024-9-25 10:43:51

手动把数据导出,自己画就可以了.gmxMMPBSA用的可视化工具是matplotlib, 而且可操作的地方不多,你的需求只需要自己把数据导出用Origin作图就能实现.

12313 · 发表于 Post on 2024-9-25 15:20:54

Loading0760 发表于 2024-9-25 10:43
手动把数据导出,自己画就可以了.gmxMMPBSA用的可视化工具是matplotlib, 而且可操作的地方不多,你的需求只需 ...

好的，谢谢老师

hugromacs · 发表于 Post on 2025-7-17 17:47:43

我想问，为什么你的能量分解这里没有带有小分子的UNK呢，我每次都有小分子，不知道如何不让其显示。

wbqdssl · 发表于 Post on 2025-7-17 17:51:46

hugromacs 发表于 2025-7-17 17:47
我想问，为什么你的能量分解这里没有带有小分子的UNK呢，我每次都有小分子，不知道如何不让其显示。

导出数据，在Origin中作图，把关于小分子的数据删掉后再作图就可以了。

hugromacs · 发表于 Post on 2025-7-17 20:20:49

wbqdssl 发表于 2025-7-17 17:51
导出数据，在Origin中作图，把关于小分子的数据删掉后再作图就可以了。

好的谢谢，就是配色不一样是吧

wbqdssl · 发表于 Post on 2025-7-17 21:12:48

hugromacs 发表于 2025-7-17 20:20
好的谢谢，就是配色不一样是吧

origin中配色可以自己调整的

hugromacs · 发表于 Post on 2025-7-18 01:48:54

wbqdssl 发表于 2025-7-17 21:12
origin中配色可以自己调整的

好的感谢感谢

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