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[辅助/分析程序] mopac2xyz工具无法转化.out文件为.xyz

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下载了Sob的mopac2xyz工具,在Win8和WinXp下,无论是工具自带的示例文件还是我自己计算的文件,都无法将.out文件转化为.xyz文件,程序闪一下就关闭了,没有.xyz文件生成,Windows是英文版,路径中没有中文等字符出现,不知原因为何?希望得到帮助,谢谢了!

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发表于 Post on 2014-12-2 12:48:58 | 只看该作者 Only view this author
把你在程序里输入的所有命令都贴一下,用自带的示例文件
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2014-12-2 17:33:59 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2014-12-2 12:48
把你在程序里输入的所有命令都贴一下,用自带的示例文件

首先谢谢你的帮助。

输入文件就是工具中自带的例子,keywords中用PRNT=2和第三行写上All coordinates are Cartesian,运算得到的.out文件拉入mopac2xyz窗口,一回车,然后。。。就没有然后了,窗口自动关闭,也没有.xyz文件出现,也无法设置获取数值的间隔。

MOPAC版本是14.330W,因为旧的到期了,用不了了,按照提示,下载的新版本:
MOPAC2012, James J. P. Stewart, Stewart Computational Chemistry,      **
**  Version 14.330W web: HTTP://OpenMOPAC.net         Days remaining: 359

输入test.mop文件如下:

PM7 CHARGE=0 PRNT=2 LET DDMIN=0.0
molecule
All coordinates are Cartesian
C  3.69700000 1  -1.33700000 1  -0.17800000 1
C  4.01300000 1   0.06400000 1  -0.65700000 1
C  3.19700000 1   1.08900000 1   0.17200000 1
C  1.72100000 1   0.79800000 1   0.10200000 1
C  1.28500000 1  -0.53300000 1   0.13700000 1
C  2.28900000 1  -1.61800000 1   0.23400000 1
C  0.80400000 1   1.83900000 1   0.02100000 1
C -0.56900000 1   1.57000000 1  -0.01500000 1
C -1.01700000 1   0.23000000 1   0.00900000 1
C -0.08100000 1  -0.83100000 1   0.06800000 1
C -2.42300000 1  -0.04900000 1  -0.02500000 1
C -2.88000000 1  -1.38700000 1  -0.01700000 1
C -1.90600000 1  -2.45100000 1   0.00600000 1
C -0.57900000 1  -2.18600000 1   0.04400000 1
C -1.54000000 1   2.63400000 1  -0.07400000 1
C -2.86800000 1   2.36900000 1  -0.09400000 1
C -3.35600000 1   1.01200000 1  -0.06700000 1
C -4.72500000 1   0.72500000 1  -0.08500000 1
C -5.16600000 1  -0.59500000 1  -0.07000000 1
C -4.25300000 1  -1.64600000 1  -0.03900000 1
O  2.81400000 1  -2.07700000 1  -1.02100000 1
O  5.38800000 1   0.25200000 1  -0.39700000 1
O  3.53400000 1   2.32300000 1  -0.43100000 1
H  3.54900000 1   1.10600000 1   1.23200000 1
H  3.82900000 1   0.19000000 1  -1.74900000 1
H  4.54800000 1  -1.89900000 1   0.21700000 1
H  2.06900000 1  -2.41500000 1   0.95300000 1
H  0.15100000 1  -2.99700000 1   0.03800000 1
H -2.27900000 1  -3.47500000 1  -0.01500000 1
H -4.61100000 1  -2.67400000 1  -0.03300000 1
H -6.23400000 1  -0.80800000 1  -0.08400000 1
H -5.44800000 1   1.53900000 1  -0.11400000 1
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发表于 Post on 2014-12-2 17:39:08 | 只看该作者 Only view this author
检查是否路径中有空格。你直接拉到mopac2xyz窗口后,如果路径两边出现了双引号一定要去掉。
mopac2xyz直接载入自带的test.out是没有问题的。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2014-12-2 18:04:19 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2014-12-2 17:39
检查是否路径中有空格。你直接拉到mopac2xyz窗口后,如果路径两边出现了双引号一定要去掉。
mopac2xyz直接 ...

非常感谢您的提示,去掉双引号就好了,图省事直接拉入了,没注意双引号的事,如果是键盘输入的话,就没这个问题了,细节决定成败啊。。。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2014-12-2 19:42:06 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2014-12-2 17:39
检查是否路径中有空格。你直接拉到mopac2xyz窗口后,如果路径两边出现了双引号一定要去掉。
mopac2xyz直接 ...

当我把此工具拷到我自己的文件夹中应用时,又出错了,经过多次试验,终于成功:

1 文件夹和文件名字中的空格没有关系;
2 总的路径长度不能超过输入窗口一行,否则出错。就因为我用的文件路径太长了,所以,开始时总出错。

不知道其他人有否此情况?

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发表于 Post on 2014-12-2 19:44:36 | 只看该作者 Only view this author
bomsaude 发表于 2014-12-2 19:42
当我把此工具拷到我自己的文件夹中应用时,又出错了,经过多次试验,终于成功:

1 文件夹和文件名字中 ...


有无空格无关。但是如果路径有空格而且你把文件直接拖进窗口,那么系统就会自动在两边加上双引号以避免整行字符被截断。
输入的文件路径总长不得超过80个字符。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2014-12-2 19:47:27 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2014-12-2 19:44
有无空格无关。但是如果路径有空格而且你把文件直接拖进窗口,那么系统就会自动在两边加上双引号以避免 ...

谢谢您的提醒,现在搞明白了:)

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