构建COF模型，加氢后优化结构不共平面的问题

小白中的小白 · 发表于 Post on 2023-3-25 16:41:57

最近刚学习利用MS构建COF模型，请教各位大神一点简单问题，感谢！请问我构建β-酮烯胺COF 时遇到了加氢后优化结构就不共平面的情况，我可以先在不加氢的情况下找到高对称性的空间群，之后升到较高的空间群，再进行加氢等后续优化吗？
求朋友们的指导感谢感谢

wangs · 发表于 Post on 2023-3-26 18:09:09

同问+1

小白中的小白 · 发表于 Post on 2023-3-28 17:10:11

wangs 发表于 2023-3-26 18:09
同问+1

加个好友? 互帮互助一下？ vx

wangs · 发表于 Post on 2023-3-29 15:53:11

可以，但我不能给你发私信

zaqxs234 · 发表于 Post on 2023-3-31 09:22:35

本帖最后由 zaqxs234 于 2023-3-31 09:24 编辑

这里中科院老师写的关于多孔材料建模方面的内容：https://www.doc88.com/p-6931338509834.html
你的做法应该是可行。还有就是力场的问题，一般UFF或者DREIDING力场比较容易得到合适的MOF/COF结构

小白中的小白 · 发表于 Post on 2023-3-31 18:30:43

zaqxs234 发表于 2023-3-31 09:22
这里中科院老师写的关于多孔材料建模方面的内容：https://www.doc88.com/p-6931338509834.html
你的做法应 ...

感谢感谢！~

小白中的小白 · 发表于 Post on 2023-3-31 18:40:48

wangs 发表于 2023-3-29 15:53
可以，但我不能给你发私信

咱俩等级太低加了好友也没办法发消息
我v 13562872535

努努力的小张 · 发表于 Post on 2024-4-19 20:40:21

先不加氢一直优化（特别注意结构对称性，还是要有晶体学基础的），然后找到高对称性。加氢后引入，在进行优化，最后加电荷。

Qualsonic · 发表于 Post on 2025-2-22 20:39:57

努努力的小张发表于 2024-4-19 20:40
先不加氢一直优化（特别注意结构对称性，还是要有晶体学基础的），然后找到高对称性。加氢后引入，在进行优 ...

是的

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