请问氢键对称代码可以通过什么软件得到？

UTM

如题，晶体结构中的氢键对称代码（比如-x,1-y,-z）是说明什么的？该怎么得到？

ChrisZheng

解晶体的软件可以得到 比如SHELXL https://shelx.uni-goettingen.de/ 的HTAB可以生成氢键的对称操作 https://shelx.uni-goettingen.de/shelxl_html.php#HTAB
晶体可视化软件可以从CIF里读取对称操作 比如Mecury (Display -> More Information -> Atom List Symm. op.)
基于晶体结构的结构验证软件可以生成 最有代表性的是platon http://www.platonsoft.nl/platon/

UTM

ChrisZheng 发表于 2022-8-17 15:08
解晶体的软件可以得到 比如SHELXL https://shelx.uni-goettingen.de/ 的HTAB可以生成氢键的对称操作 https: ...

好的，谢谢！
请问对称代码能说明什么呢？为什么有的氢键有有的没有？

ChrisZheng

UTM 发表于 2022-8-18 02:14
好的，谢谢！
请问对称代码能说明什么呢？为什么有的氢键有有的没有？

a) 对称操作代码是表示晶体里重复结构的方式

b) 晶体结构画图可以分为两类 一类展示不对称单元 一类展示超分子结构

比如一个晶体是通过氢键结合到一起的二聚体 不对称单元包含组成二聚体的两个完整的分子 那么 只画不对称单元 氢键就没有对称操作 因为这种情况的对称操作就是x, y, z

而如果两个分子其中一个是反演对称出来的 画超分子结构的时候 氢键可能是 O-H...Oi i对称操作是-x, -y, -z

UTM

ChrisZheng 发表于 2022-8-19 17:34
a) 对称操作代码是表示晶体里重复结构的方式

b) 晶体结构画图可以分为两类 一类展示不对称单元 一类展 ...

哦哦好的，谢谢老师