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[综合交流] 请教:SOMO分子轨道的问题

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本帖最后由 mcandg03 于 2014-11-20 09:03 编辑

最近看到一篇文章使用SOMO分子轨道探讨抽氢反应机理,请问SOMO分子轨道图是怎么得到?计算如何设置?是不是要用ROHF?谢谢!

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发表于 Post on 2014-11-20 10:18:25 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 jiewei 于 2014-11-20 12:37 编辑

sorry,没看到是抽氢的问题。 此贴作废...

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发表于 Post on 2014-11-20 10:37:27 | 只看该作者 Only view this author
这个情况必须用ROHF或者RODFT(如ROB3LYP)计算,不能用非限制性计算(如UHF)。然后结果中能量最高的一个或多个轨道将是单占据的,就是SOMO了(其余轨道都是双占据的),用Multiwfn等程序看其轨道图形即可。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2014-11-20 16:45:37 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2014-11-20 10:37
这个情况必须用ROHF或者RODFT(如ROB3LYP)计算,不能用非限制性计算(如UHF)。然后结果中能量最高的一个 ...

谢谢sob老师。如果单占据的分子轨道遍布与全分子的话,就说这个抽氢反应就是质子耦合电子转移机理。此结论的理论依据有吗?

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发表于 Post on 2014-11-20 17:14:20 | 只看该作者 Only view this author
你说的质子耦合电子转移机理我不太清楚
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发表于 Post on 2014-11-20 18:03:48 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2014-11-20 10:37
这个情况必须用ROHF或者RODFT(如ROB3LYP)计算,不能用非限制性计算(如UHF)。然后结果中能量最高的一个 ...

我记得Pople写过一篇文章,DFT的RO方法没意义,不建议使用,
Spin unrestricted character of Kohn-Sham Orbitals for Open Shell Systems
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发表于 Post on 2014-11-20 18:06:13 | 只看该作者 Only view this author
jiangning198511 发表于 2014-11-20 18:03
我记得Pople写过一篇文章,DFT的RO方法没意义,不建议使用,
Spin unrestricted character of Kohn-Sham ...

不至于没意义,至少实际意义还是有的,只不过没有特殊必要的话,不建议用RO,对于HF也是。
收敛难,耗时多,能量不如U准确,自旋密度不合理。唯一的好处就是解释波函数比较方便。
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发表于 Post on 2014-11-20 18:14:30 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2014-11-20 18:06
不至于没意义,至少实际意义还是有的,只不过没有特殊必要的话,不建议用RO,对于HF也是。
收敛难,耗时 ...

貌似这个问题到现在还没有定论,DFT中的坑太多了,哈哈
难怪有人说过,我们知道为什么波函数方法不好,但我们不知道为什么DFT好 :P

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发表于 Post on 2014-11-20 18:36:10 | 只看该作者 Only view this author
jiangning198511 发表于 2014-11-20 18:14
貌似这个问题到现在还没有定论,DFT中的坑太多了,哈哈
难怪有人说过,我们知道为什么波函数方法不好, ...

DFT的自旋污染也是主要争议之一
黑箱程度太高,而且实践经验总能胜过理论上的教条,尽管这也导致了DFT发展的有点走向歪门邪道
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发表于 Post on 2014-11-20 22:02:00 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2014-11-20 18:36
DFT的自旋污染也是主要争议之一
黑箱程度太高,而且实践经验总能胜过理论上的教条,尽管这也导致了DFT发 ...

:lol我又想起Becke那句“一切都合法”
日常打哑谜&&探寻更多可能。
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