求助：关于Number of Rotatable Bonds的理解

xxtnenu

本人的研究方向是QSAR，最近写文章讨论描述符时遇到了一些不解，恳请得到老师们的解答。

QSAR中包含了一个重要的描述符Number of Rotatable Bonds (NRB)，即可旋转键的个数。通常围绕该描述符简单讨论其可能对因变量带来的影响即可，但是在查找有关NRB的时候看到一篇论文：Flexibility in early drug discovery: focus on the beyond-Rule-of-5 chemical space.https://doi.org/10.1016/j.drudis.2020.01.012. 这篇论文表示NRB虽被广泛使用，但该描述符仍存在一些问题，包括：1.忽略了环状结构的灵活性，如正十二烷的NRB=9，而环十二烷的NRB=0，即环状部分对分子的总体柔韧性没有贡献。而对一些稀土DOTA络合物的研究表明环状部分有助于分子的整体柔韧性；

2.与其离散性（discrete nature）（不确定该如何理解这个词）有关，即4种化学结构和柔韧性差异很大的化合物可能有着相同的NRB值；
3.由于其2D的性质，NRB不能区分立体异构体和区域异构体。

结合上述内容我对自己论文内容的讨论：
1.本研究的数据集为190种化合物，且这190种化合物中基本没有大环结构的化合物存在，因此在本研究中可以忽略缺陷1；
2.本研究的QSAR模型包含多个描述符，因此即便可能存在缺陷2的情况也可以忽略；
3.研究的背景是配体-受体结合导致受体活性受到抑制，因此在QSAR中引入了结合能，相互作用能和3D描述符弥补缺陷3带来的问题。

请问各位老师，我的讨论是否是合理的。

sobereva

都没明白你要研究什么，帖子想问什么