使用了Sob编写gau_xtb程序的JACS文章——吡喃酮类新型生物合成机制：周环反应分叉

zsu007 · 发表于 Post on 2021-7-27 12:42:11

本帖最后由 zsu007 于 2021-7-27 12:43 编辑

请看X-Mol资讯

吡喃酮类新型生物合成机制：周环反应分叉现象

granvia · 发表于 Post on 2021-7-27 12:47:11

又见绿巨人 :D

lijiayisjtu · 发表于 Post on 2021-7-28 10:22:05

又是K.N.HOUK组的发的JACS，他们组quasiclassical MD，ambimodal TS，Diels−Alder反应，周环反应都属于他们组长期进行的相关课题和技术手段了，
这一套学会了很快，同时跟也是UCLA的Yi Tang实验合作，挖掘天然产物或者酶催化反应，发文章太猛了

zx4562430 · 发表于 Post on 2021-7-28 11:02:12

我记得TIP3P在MD中不是非常好的水模型，gaussian中的水模型ief-PCM和SMD是最好的，这个文章是不是应该采用更好的水模型呢？

snljty · 发表于 Post on 2021-7-28 11:31:44

Houk组是不是有哪位中国人带过去了不少社长的程序，最近看他们用sobMECP之类的。

zjxitcc · 发表于 Post on 2021-7-28 11:44:38

zx4562430 发表于 2021-7-28 11:02
我记得TIP3P在MD中不是非常好的水模型，gaussian中的水模型ief-PCM和SMD是最好的，这个文章是不是应该采用 ...

此类课题较新，研究手段不是那种简单找找过渡态、算算反应能垒。在被大家学会整个套路灌水前，计算级别不是那么重要，揭示insight更为重要。

zx4562430 · 发表于 Post on 2021-7-28 12:41:27

zjxitcc 发表于 2021-7-28 11:44
此类课题较新，研究手段不是那种简单找找过渡态、算算反应能垒。在被大家学会整个套路灌水前，计算级别不 ...

了解了，老师

lijiayisjtu · 发表于 Post on 2021-7-28 14:18:06

K.N.HOUK组本来就属于计算领域的大佬，审稿人也很难去质疑他们所用的计算方法，比如他们组一直用CPCM的溶剂模型，最近一两年都用wB97X-D泛函去算。不过他们揭示的机制都很新，找些特色特点去学习

非十二子 · 发表于 Post on 2024-9-19 15:54:13

科研思路真是妙！

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