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[Gaussian/gview] 求教优化一个夹层化合物方法和基组选择,怎样算可以缩短耗时?

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各位老师,我最近在优化一个夹层化合物,很多次都没成功,算了几天了。它含有过渡金属,其中19个Ge、3个pd、3个P、9个苯环,还带有负电荷。希望各位老师可以建议一下使用的方法和基组,指点一下我,非常感谢!(我现在想先用一个小基组进行优化,然后再用大基组优化。)目前用的是PBE0/def2tzvp。
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发表于 Post on 2021-7-21 22:58:11 | 只看该作者 Only view this author
先把def2TZVP减到def2SVPP。如果还不行,把PBE0换成BP86然后开密度拟合。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
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ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
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发表于 Post on 2021-7-22 02:01:40 | 只看该作者 Only view this author
Ge和Pd用lan08(d),其它用6-311G*

说清楚计算资源,否则没法准确推荐。反正一般情况优化都不要用def2-TZVP那么大,带f极化太耗时
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-7-22 12:46:44 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wy标点人生 于 2021-7-22 12:50 编辑
sobereva 发表于 2021-7-22 02:01
Ge和Pd用lan08(d),其它用6-311G*

说清楚计算资源,否则没法准确推荐。反正一般情况优化都不要用def2-TZ ...

好的,谢谢卢老师!计算资源的话,有13个节点,每个节点40核,目前只有我一个人用。但是我发现这个超算算的慢
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-7-22 12:50:26 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-7-21 22:58
先把def2TZVP减到def2SVPP。如果还不行,把PBE0换成BP86然后开密度拟合。

嗯,谢谢老师,我会参考的!密度拟合怎么开呢?
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发表于 Post on 2021-7-22 14:51:21 | 只看该作者 Only view this author
wy标点人生 发表于 2021-7-22 05:50
嗯,谢谢老师,我会参考的!密度拟合怎么开呢?

http://gaussian.com/densityfit/
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BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
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发表于 Post on 2021-7-22 21:28:42 | 只看该作者 Only view this author
wy标点人生 发表于 2021-7-22 12:46
好的,谢谢卢老师!计算资源的话,有13个节点,每个节点40核,目前只有我一个人用。但是我发现这个超算算 ...

其实,你可以说的更清楚些,例如,CPU的型号(包括主频)之前似乎看到过高斯的多节点的并行效率不高,  群里好像有相关的帖子,建议可以先简单测试一下,再计算,这样可以节约时间

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发表于 Post on 2021-7-23 03:29:10 | 只看该作者 Only view this author
wy标点人生 发表于 2021-7-22 12:46
好的,谢谢卢老师!计算资源的话,有13个节点,每个节点40核,目前只有我一个人用。但是我发现这个超算算 ...

如果你是跨节点跑的,不要跨节点,否则如果只是以太网方式互联节点,跨节点跑Gaussian比不跨还慢
Gaussian最适合的是在单个胖节点上跑

当前计算资源情况下,单节点40核并行,用我前面推荐的级别优化不会多费劲

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-7-23 22:39:31 | 只看该作者 Only view this author
风飞 发表于 2021-7-22 21:28
其实,你可以说的更清楚些,例如,CPU的型号(包括主频)之前似乎看到过高斯的多节点的并行效率不高,   ...

好的,谢谢老师!
CPU:Intel XEON V4处理器E5-2600系列,配置2路40物理核80计算核心,64位,中心处理器主频2000MHz,三级缓存2*50M=100MCACHE
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-7-23 22:40:39 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-7-23 03:29
如果你是跨节点跑的,不要跨节点,否则如果只是以太网方式互联节点,跨节点跑Gaussian比不跨还慢
Gaussi ...

好的,谢谢老师!
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-7-23 23:04:00 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-7-22 14:51
http://gaussian.com/densityfit/

好的,谢谢老师,我先前看看!
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