计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 12259|回复 Reply: 16
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Lammps] 求助如何分析界面上水分子的偶极取向

[复制链接 Copy URL]

13

帖子

0

威望

121

eV
积分
134

Level 2 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
请教一下各位大佬。我是用lammps模拟了一个氧化镁壁面上水分子的润湿过程(如图一)。现在我想求水分子的偶极与壁面法相所成的夹角(如图二)。以此来作图三或者图四这样的图。请求各位做过类似工作的大佬给一个类似的脚本,或者有没有编程大佬能帮助我写一个后处理脚本。感激不尽,有偿也可以。

图4.png (194.4 KB, 下载次数 Times of downloads: 50)

图4.png

图3.png (160.52 KB, 下载次数 Times of downloads: 50)

图3.png

图二.png (33 KB, 下载次数 Times of downloads: 47)

图二.png

图一.png (335.86 KB, 下载次数 Times of downloads: 53)

图一.png

9

帖子

0

威望

63

eV
积分
72

Level 2 能力者

2#
发表于 Post on 2021-6-27 09:02:26 | 只看该作者 Only view this author
震惊、。。。。。我也要算分子取向。。。。。。。。。

308

帖子

2

威望

3557

eV
积分
3905

Level 5 (御坂)

3#
发表于 Post on 2021-6-27 12:48:50 | 只看该作者 Only view this author
这个算是比较简单的编程了,你可以网盘发一段成品xyz轨迹上来我测试一下,我以前写过计算有序参数也就是3/2cosθ^2-0.5的那种,我测试下看是否正确,正确的话我可以提供给你。

13

帖子

0

威望

121

eV
积分
134

Level 2 能力者

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-6-28 10:30:17 | 只看该作者 Only view this author
lyj714 发表于 2021-6-27 12:48
这个算是比较简单的编程了,你可以网盘发一段成品xyz轨迹上来我测试一下,我以前写过计算有序参数也就是3/2 ...


非常感谢您。我把相关的轨迹文件打包放在了百度网盘里,您可以下下来试试。链接:https://pan.baidu.com/s/1R2RpCLSEfzuUgVWQ8W2isg
提取码:m7p2

您可以加我微信,微信号:ymswDezzw

13

帖子

0

威望

121

eV
积分
134

Level 2 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-7-3 10:40:47 | 只看该作者 Only view this author
自问自答一下,我自己写好了这一脚本文件。所以不再需要了,谢谢。

10

帖子

0

威望

75

eV
积分
85

Level 2 能力者

6#
发表于 Post on 2021-7-22 22:59:34 | 只看该作者 Only view this author
楼主您好,请问可以分享一下代码吗

13

帖子

0

威望

121

eV
积分
134

Level 2 能力者

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-8-25 15:20:24 | 只看该作者 Only view this author
大石头 发表于 2021-7-22 22:59
楼主您好,请问可以分享一下代码吗

你好,还需要的话可以加我微信。微信号ymswDezzw

15

帖子

0

威望

39

eV
积分
54

Level 2 能力者

8#
发表于 Post on 2022-1-4 22:20:58 | 只看该作者 Only view this author
您好,我想学习一下您算水的偶极取向的程序,发现您的微信号变了,可否告诉我一下

74

帖子

0

威望

247

eV
积分
321

Level 3 能力者

9#
发表于 Post on 2022-2-11 21:17:31 | 只看该作者 Only view this author
大石头 发表于 2021-7-22 22:59
楼主您好,请问可以分享一下代码吗

您好,我也想学习这个代码,可以分享一下嘛

74

帖子

0

威望

247

eV
积分
321

Level 3 能力者

10#
发表于 Post on 2022-2-11 21:17:57 | 只看该作者 Only view this author
ymsw_zzw 发表于 2021-8-25 15:20
你好,还需要的话可以加我微信。微信号ymswDezzw

楼主请问咋联系你呀?

10

帖子

0

威望

113

eV
积分
123

Level 2 能力者

11#
发表于 Post on 2022-9-18 20:30:44 | 只看该作者 Only view this author
怎么联系

1

帖子

0

威望

23

eV
积分
24

Level 1 能力者

12#
发表于 Post on 2023-4-26 10:16:37 | 只看该作者 Only view this author
楼主你好,我也要算取向,请问能看一下你的代码吗,我自己的代码出来的结果很奇怪,想参考一下

365

帖子

5

威望

3869

eV
积分
4334

Level 6 (一方通行)

Nerv

13#
发表于 Post on 2023-4-26 13:11:59 | 只看该作者 Only view this author
轨迹转成gro文件做个gmx h2order试试?
God's in his heaven,all is right with the world

40

帖子

0

威望

261

eV
积分
301

Level 3 能力者

14#
发表于 Post on 2023-6-14 14:49:48 | 只看该作者 Only view this author
ymsw_zzw 发表于 2021-7-3 10:40
自问自答一下,我自己写好了这一脚本文件。所以不再需要了,谢谢。

您好,我最近也在做类似的工作,方便提供一下您的脚本思路么?多谢!

1

帖子

0

威望

103

eV
积分
104

Level 2 能力者

15#
发表于 Post on 2023-10-24 14:58:30 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 mm0317ky 于 2024-5-13 13:13 编辑
ymsw_zzw 发表于 2021-7-3 10:40
自问自答一下,我自己写好了这一脚本文件。所以不再需要了,谢谢。


本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-17 11:53 , Processed in 0.217013 second(s), 29 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list