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计算化学公社»论坛首页 › 理论与计算化学 (Theoretical and Computational Chemistry) › 第一性原理 (First-principles) › 求助：磺酸基催化水解的过渡态搜索问题

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[VASP] 求助：磺酸基催化水解的过渡态搜索问题

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发表于 Post on 2020-9-11 10:46:24 | 只看该作者 Only view this author |只看大图 View big picture 回帖奖励

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各位老师好，小弟最近在uio-66上接枝磺酸基来研究磺酸基对纤维二糖的水解机理. 采用MS建模后带入vasp进行结构优化，如下图所示，发现系统中所有原子除了磺酸基上氢原子都达到了力的收敛标准。我们想问下，当采用CINEB研究磺酸基对纤维二糖的水解过渡态时，能不能将磺酸基上的氢去掉，在初始结构中加几个水分子来构建溶液环境。

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发表于 Post on 2020-9-11 11:50:59 | 只看该作者 Only view this author

可以（而且必须）加水分子。既然是水解，我猜你的溶剂是水，那么磺酸基必然会和好几个水形成强氢键，甚至直接把质子电离给水。如果不加水，相当于本来一个稀硫酸催化的反应变成了用浓硫酸催化，完全不是一码事了。

Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心研究员
BDF（https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html）、ORCA（https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php）开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页：http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生，有意者可私信联系

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楼主 Author| 发表于 Post on 2020-9-12 23:43:11 | 只看该作者 Only view this author

wzkchem5 发表于 2020-9-11 11:50
可以（而且必须）加水分子。既然是水解，我猜你的溶剂是水，那么磺酸基必然会和好几个水形成强氢键，甚至直 ...

谢谢您。

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发表于 Post on 2020-11-28 17:22:29 | 只看该作者 Only view this author

您好师兄，您也在做水解吗？能给师弟一个联系方式吗，最近也在做这个想请教下师兄

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