计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 3896|回复 Reply: 5
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

如何把单晶结构的坐标导出来

[复制链接 Copy URL]

110

帖子

0

威望

1123

eV
积分
1233

Level 4 (黑子)

请问怎么把单晶结构的坐标信息导出来,然后进行下一步计算。

谢谢!

15

帖子

1

威望

963

eV
积分
998

Level 4 (黑子)

2#
发表于 Post on 2020-8-8 18:38:15 | 只看该作者 Only view this author
不大清楚你要如何导出,导出什么格式的,是周期的还是其中的一个分子。 可以用MS导出,也可以用Mercury导出,也可以用gview导出

110

帖子

0

威望

1123

eV
积分
1233

Level 4 (黑子)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-8-8 18:42:42 | 只看该作者 Only view this author
ArchieMiao 发表于 2020-8-8 18:38
不大清楚你要如何导出,导出什么格式的,是周期的还是其中的一个分子。 可以用MS导出,也可以用Mercury导出 ...

是直接在gview里打开cif文件吗?当然能导出成gjf文件最好了,谢谢。

110

帖子

0

威望

1123

eV
积分
1233

Level 4 (黑子)

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-8-8 19:57:50 | 只看该作者 Only view this author
ArchieMiao 发表于 2020-8-8 18:38
不大清楚你要如何导出,导出什么格式的,是周期的还是其中的一个分子。 可以用MS导出,也可以用Mercury导出 ...

您好,我用mercury打开res文件,导出成mol2文件了,但是缺少了H原子的坐标信息,请问这个怎么完善呢

10

帖子

0

威望

219

eV
积分
229

Level 3 能力者

5#
发表于 Post on 2020-8-8 23:27:58 | 只看该作者 Only view this author
anlancx 发表于 2020-8-8 19:57
您好,我用mercury打开res文件,导出成mol2文件了,但是缺少了H原子的坐标信息,请问这个怎么完善呢

你的mercury应该是隐藏H了,打开就行

110

帖子

0

威望

1123

eV
积分
1233

Level 4 (黑子)

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-8-9 11:46:45 | 只看该作者 Only view this author
lanthanides 发表于 2020-8-8 23:27
你的mercury应该是隐藏H了,打开就行

好的,谢谢您,已经解决了

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-15 08:09 , Processed in 0.151037 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list