计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 8877|回复 Reply: 9
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[CP2K] CP2K CINEB 求助

[复制链接 Copy URL]

68

帖子

0

威望

639

eV
积分
707

Level 4 (黑子)

1、CP2K 做CINEB, 其中控制插点数目的参数NUM_REPLICAS 是包含了初态和末态两个点的吗? 那么为什么明明已经设置了不优化初态末态的点(OPTIMIZE_END_POINTS FALSE), 可是需要的核数目仍然还是要设置成NPROC_REP * NUM_REPLICAS 呢? 譬如我先在要在初态和末态之间插入5个Image,每个Image 用1个节点28个核计算(NPROC_REP 28),那么不是只需要140和核就行吗,可是为什么实际必须要提供7*28 个核呢?

2、在不优化初态和末态的基础上,插入5个点, 为什么在.out 文件里面显示用了5个image 5个replica 而不是3个image 5个replica; (VASP 里面image值得就是初态和末态之间的)

689

帖子

2

威望

4194

eV
积分
4923

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2020-6-1 16:52:20 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 jiangning198511 于 2020-6-1 16:54 编辑

看看这个例子 https://www.cp2k.org/exercises:2020_uzh_acpc2:ex03

68

帖子

0

威望

639

eV
积分
707

Level 4 (黑子)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-6-1 16:56:30 | 只看该作者 Only view this author
jiangning198511 发表于 2020-6-1 16:52
是中间的5个点,你可以先跑跑例子文件看看

谢谢您的回复,我仔细看过了,CP2K生成的*pos.xyz 文件,第一个和最后一个的坐标和提供的初态末态的坐标基本是一致的,难道是我体系的原因吗

68

帖子

0

威望

639

eV
积分
707

Level 4 (黑子)

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-6-1 16:59:01 | 只看该作者 Only view this author
zhou9527 发表于 2020-6-1 16:56
谢谢您的回复,我仔细看过了,CP2K生成的*pos.xyz 文件,第一个和最后一个的坐标和提供的初态末态的坐标 ...

就是CP2K插的第一个点和最后一个点跟初态和末态的坐标基本是一样的

68

帖子

0

威望

639

eV
积分
707

Level 4 (黑子)

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-6-1 17:01:55 | 只看该作者 Only view this author
jiangning198511 发表于 2020-6-1 16:52
看看这个例子 https://www.cp2k.org/exercises:2020_uzh_acpc2:ex03

哦哦, 好的,谢谢谢谢

689

帖子

2

威望

4194

eV
积分
4923

Level 6 (一方通行)

6#
发表于 Post on 2020-6-1 17:01:58 | 只看该作者 Only view this author
zhou9527 发表于 2020-6-1 16:59
就是CP2K插的第一个点和最后一个点跟初态和末态的坐标基本是一样的

看看这个例子 https://www.cp2k.org/exercises:2020_uzh_acpc2:ex03

12

帖子

0

威望

405

eV
积分
417

Level 3 能力者

7#
发表于 Post on 2020-7-12 13:32:31 | 只看该作者 Only view this author
楼主你好,请问这个问题解决了吗?如何设置才能舍去始末态的结构优化?

12

帖子

0

威望

405

eV
积分
417

Level 3 能力者

8#
发表于 Post on 2020-7-12 13:33:12 | 只看该作者 Only view this author
Number of Images 和  Number of Replicas:分别代表说什么?多谢赐教》》》

68

帖子

0

威望

639

eV
积分
707

Level 4 (黑子)

9#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-7-12 21:21:47 | 只看该作者 Only view this author
jianying8996 发表于 2020-7-12 13:33
Number of Images 和  Number of Replicas:分别代表说什么?多谢赐教》》》

这个是CP2K的bug吧,初态和末态即使设置不优化,同样也需要吃相应的资源。官网解释前者表示在初态和末态的插点数目,后面表示所有的点。但是我计算的发现是一回事~~~

12

帖子

0

威望

405

eV
积分
417

Level 3 能力者

10#
发表于 Post on 2020-7-14 10:47:33 | 只看该作者 Only view this author
zhou9527 发表于 2020-7-12 21:21
这个是CP2K的bug吧,初态和末态即使设置不优化,同样也需要吃相应的资源。官网解释前者表示在初态和末态 ...

对,我也发现相应的问题了,昨天试了一组,其实Number of Images 随便设置一个值,主要还是取决于计算节点和总核数,然后使input.inp中的Number of Replicas,images就是这两者的除数。

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-18 05:59 , Processed in 0.234478 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list