请教：可以查找相似化合物的网站或软件

李德贤

我有一个化合物dodecan-12-olide，想查一下它的相似化合物，特别是想找有相同C原子数的环，请问有什么好的方法？

PubChem的Find Similar Structures感觉不太理想

liyuanhe211

“相似”这个说法太模糊了，谁也不知道（包括人和程序）你想找的是在哪方面相似的东西。

（你确实说了个“相同碳原子数的环”，这个检索其实可以用一些数据库的检索语言实现，但着实没提供多少有用信息，可能还有误导性，例如“环十二烷”相似吗？18-冠-6相似吗？环状碳硅醚...-C-O-Si-O-...相似吗？有桥环、并环的情况是否考虑？我是想不出什么实用情况能包括这些分子。）

最好给出研究背景（例如要做个大环内酯化反应等等）或者给出尽可能多的、有代表性的哪些化合物是你认为相似的，哪些化合物不是你认为相似的。

indec

SciFinder 可以根据相似度搜索化合物。

李德贤

liyuanhe211 发表于 2019-6-29 19:44
“相似”这个说法太模糊了，谁也不知道（包括人和程序）你想找的是在哪方面相似的东西。

（你确实说了个 ...

谢谢您的答案。
我想做的是3d-qsar，已经知道这个化合物活性很高，并且有文献猜测内酯和环结构是关键的药效团，所以想找一些带有这么大的环和内酯的化合物，测一下活性。

李德贤

indec 发表于 2019-6-30 02:47
SciFinder 可以根据相似度搜索化合物。

这个是需要付费的吧？