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[蛋白质建模] 请教:Swiss-model 和 Modeller 建模质量比较

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Level 4 (黑子)

我有一段大约100个氨基酸的蛋白质,需要进行建模,用Swiss-model查询模板序列同源性最好的是41%,想请问大家在这种情况下用Swiss-model 和 Modeller建模哪个更好一些?
另外还想问下评价建模质量用那些指标更好?谢谢大家

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Level 5 (御坂)

2#
发表于 Post on 2019-2-10 18:42:06 | 只看该作者 Only view this author
试试Rosetta ab inito. 100AA 41%同源性,最后出来的模型精度应该不错

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李德贤 + 1 谢谢

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主攻: 蛋白-蛋白对接,蛋白de novo设计、蛋白结构建模,抗体设计等方向。Rosetta/PyRosetta

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Level 2 能力者

3#
发表于 Post on 2019-3-24 19:33:51 | 只看该作者 Only view this author
都做同源建模,最后通过评分看哪个好呀

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