GROMACS 2019已发布

sobereva · 发表于 Post on 2019-1-2 06:35:11

2019版正式版已经发布，并没啥新功能，主要还是进一步改进GPU加速代码，并且在细枝末节上缝缝补补。release note见http://manual.gromacs.org/2019/release-notes/index.html
程序可以在此下载：ftp://ftp.gromacs.org/pub/gromacs/gromacs-2019.tar.gz
手册在此下载：ftp://ftp.gromacs.org/manual/manual-2019.pdf

2019版的手册倒是焕然一新，从2018.4的270页增加到614页，膨胀这么多主要是把之前版本手册里被砍掉而弄到网站上的mdp参数介绍、子程序的用法介绍都恢复了。这样好，之前砍掉这些重要内容纯粹给用户添麻烦，用户还得去官网看，没网的时候就麻烦了。而且手册里添加了对开发者的信息，还把之前网站上七零八碎的技巧、术语说明、FAQ之类的信息都整合到了手册里。

新版本把隐式溶剂模型的功能给砍了（理由是Since nobody wants to fix it, the feature has been removed），这简直是倒退，N年来gmx一直在新功能上没啥作为，QMMM接口一直不给整好了，还把之前残缺不全的接口给砍了。

lijiayisjtu · 发表于 Post on 2019-1-2 09:31:12

谢谢老师！

gsbear · 发表于 Post on 2019-1-2 11:28:19

国内下载老是不会动，无奈只有挂上梯子f墙了，不知道是不是只有我的网络是这种情况？

另外，为了方便墙内和我一样被困扰的人，传个到网盘吧，需要的自取。

链接：https://pan.baidu.com/s/1lm4F10GcyNGLoqJy6j0wTQ 密码：ct3u

gsbear · 发表于 Post on 2019-1-2 11:30:55

gsbear 发表于 2019-1-2 11:28
国内下载老是不会动，无奈只有挂上梯子翻墙了，不知道是不是只有我的网络是这种情况？

另外，为了方便墙 ...

注：墙外无法访问网盘共享，刚才挂着梯子忘记关，说是测试一下链接，结果就......404了

hyj · 发表于 Post on 2019-3-28 09:06:11

我下载了GROMACS 2019这个文件夹，但是并没有找到应用程序，求问应用程序长什么样子啊

sobereva · 发表于 Post on 2019-3-28 23:13:53

hyj 发表于 2019-3-28 09:06
我下载了GROMACS 2019这个文件夹，但是并没有找到应用程序，求问应用程序长什么样子啊

看不懂你的问题
怎么安装看
GROMACS的原生Windows版的编译和安装方法
http://sobereva.com/458（http://bbs.keinsci.com/thread-11848-1-1.html）
GROMACS的安装方法（含全程视频演示）
http://sobereva.com/457（http://bbs.keinsci.com/thread-11821-1-1.html）

hyj · 发表于 Post on 2019-3-29 21:49:47

谢谢社长，我去看看

naoki · 发表于 Post on 2019-3-30 10:01:40

sobereva 发表于 2019-3-28 23:13
看不懂你的问题
怎么安装看
GROMACS的原生Windows版的编译和安装方法

Sob老师，想请教您一下，现在使用2018.6版本有必要升级到2019吗，谢谢～

sobereva · 发表于 Post on 2019-3-30 11:43:40

naoki 发表于 2019-3-30 10:01
Sob老师，想请教您一下，现在使用2018.6版本有必要升级到2019吗，谢谢～

没必要

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