投递VASP到作业管理系统的脚本问题

zyj19831206 · 发表于 Post on 2018-9-16 20:31:44

本帖最后由 zyj19831206 于 2018-9-16 20:44 编辑

准备好了VASP需要的四个文件，INCAR,POSCAR,POTCAR KPOINTS.用这个脚本投递，但是总是不成功，请高手看看，这个脚本是否还有错误？#!/bin/bash
#PBS -q middle
#PBS -N vasp
#PBS -l nodes=1:ppn=28
#PBS -j oe
#PBS -V
#PBS -l walltime=1500:00:00
cd $PBS_O_WORKDIR
EXEC=/public/home/zyj/vasp/vasp.5.4.4/bin/vasp_std
LOG_FILE=vasptest.log
NP=`cat $PBS_NODEFILE | wc -l`
NN=`cat $PBS_NODEFILE | sort | uniq | tee /tmp/nodes.$$ | wc -l`

cp $PBS_NODEFILE node

mpirun -np $NP -machinefile node $EXEC > $LOG_FILE

pwzhou · 发表于 Post on 2018-9-17 09:05:39

脚本看起来问题不大，既然不成功就把不成功的错误信息具体描述一下，这样才好知道是什么原因。

zyj19831206 · 发表于 Post on 2018-9-17 11:34:57

pwzhou 发表于 2018-9-17 09:05
脚本看起来问题不大，既然不成功就把不成功的错误信息具体描述一下，这样才好知道是什么原因。

啥报错都没，就是./vasp.sh后，啥信息都没，这就让人抓狂。。。

lcq845402558 · 发表于 Post on 2018-9-17 11:56:40

zyj19831206 发表于 2018-9-17 11:34
啥报错都没，就是./vasp.sh后，啥信息都没，这就让人抓狂。。。

我提交到作业管理一般是qsub vasp.sh ./的话我觉得提交到管理节点了。

万里云 · 发表于 Post on 2018-9-17 14:30:11

bsub < vasp.sh

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