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[VMD] 如何屏蔽选定原子/区域的等值面

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本帖最后由 终_焉 于 2018-8-29 19:09 编辑

我通过Multiwfn对体系进行分析,得到了ELF.cub文件,希望通过VMD逐层显示不同等值面。
但体系骨架被氢包围,因此包围着氢的等值面对显示效果产生了很大干扰。氢周围的等值面不是我关注的要点,我希望骨架的信息能被更好地显示。
因此我希望将氢周围的等值面屏蔽,但是当Drawing Method选为Isofurface时,不能在面板上指认原子。因此请教大家:
在绘制等值面时,VMD中有办法屏蔽选定原子或者区域吗?可以的话大概是什么思路?如果不行的话,大家有其他的建议吗?谢谢大家。










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发表于 Post on 2018-8-29 19:37:52 | 只看该作者 Only view this author
VMD里做不到,这是计算格点数据层面上的事情
利用Multiwfn的主功能13可以对某些区域的格点数据进行屏蔽,看Multiwfn手册4.13.4节
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-8-29 21:04:11 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-8-29 19:37
VMD里做不到,这是计算格点数据层面上的事情
利用Multiwfn的主功能13可以对某些区域的格点数据进行屏蔽, ...

好的。谢谢Sob老师。
我在Multiwfn中,通过将骨架一定距离外的格点数据设置为0,解决了问题。

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