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楼主 Author: sobereva
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[Multiwfn使用咨询] 简单Multiwfn使用问题和波函数分析问题答疑专贴

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发表于 Post on 2018-11-7 23:14:42 | 只看该作者 Only view this author
老师,ni的电子排布是d8s2,Cu的电子排布是d10s1,为什么在Ni-Cu+的LMO中,现实Ni轨道的5个d轨道都填满了,内层轨道的电子不参与成键。感觉那儿有问题,但是又没法解释。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-11-8 00:03:55 | 只看该作者 Only view this author
lufenghxu 发表于 2018-11-7 23:14
老师,ni的电子排布是d8s2,Cu的电子排布是d10s1,为什么在Ni-Cu+的LMO中,现实Ni轨道的5个d轨道都填满了, ...

并非Ni的所有5个d都充满了
用Multiwfn做Mulliken布居分析可以看到
Atom     1(Ni) s: 2.4244 p: 6.0486 d: 8.9484 f: 0.0001 g: 0.0000 h: 0.0000
Atom     2(Cu) s: 2.5507 p: 6.0773 d: 9.9505 f: 0.0000 g: 0.0000 h: 0.0000
明显Ni在此分子内不是d10组态

做定域化之后,看轨道可发现Ni的dxy,dyz,dxz,dx^2-y^2都是完美双占据的,但是dz2是用于与Cu成键的轨道,这个LMO上的2个电子不能都算到Ni上

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发表于 Post on 2018-11-8 01:03:27 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-11-8 00:03
并非Ni的所有5个d都充满了
用Multiwfn做Mulliken布居分析可以看到
Atom     1(Ni) s: 2.4244 p: 6.048 ...

谢谢老师的回复。我一直有个疑惑,那就是原子的时候Ni的d轨道有两个是单电子,现在Ni和Cu之间只形成单键(mayer键级0.8974),应该还有一个d轨道是单电子,为什么又形成4个双占据呢?其中一个单电子d轨道的是哪儿来的一个电子让它成了双占据?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-11-8 02:59:00 | 只看该作者 Only view this author
lufenghxu 发表于 2018-11-8 01:03
谢谢老师的回复。我一直有个疑惑,那就是原子的时候Ni的d轨道有两个是单电子,现在Ni和Cu之间只形成单键 ...

原子形成分子之后电子结构会明显发生改变,电子在不同原子轨道间会转移,在原子间也会发生转移。此时体系都是闭壳层的,原子也不可能还有单电子。
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发表于 Post on 2018-11-8 22:03:59 | 只看该作者 Only view this author
老师,通过轨道分析化学结构时,什么时候用CMO,什么时候用LMO?对于类似的体系,是都必须用统一的轨道(要么统一用CMO,要么统一用LMO),还是只要能说明问题都可以?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-11-9 02:56:29 | 只看该作者 Only view this author
lily19830130 发表于 2018-11-8 22:03
老师,通过轨道分析化学结构时,什么时候用CMO,什么时候用LMO?对于类似的体系,是都必须用统一的轨道(要 ...

看具体问题。
比如使用前线轨道理论预测反应位点、相位匹配之类的,那就只能MO,因为前线轨道这个词是对MO来说的。
如果讨论成键本质问题,就应当用LMO或者AdNDP

没有什么“统一”的要求。关键还是要把各种轨道本质特征、物理意义搞清楚,自然就知道什么时候该用什么、能用什么轨道讨论了。
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发表于 Post on 2018-11-13 15:15:30 | 只看该作者 Only view this author
ABetaCarw 发表于 2018-7-16 11:29
老师好,我用#p b3lyp/genecp(6-31G* Lanl2dz) scrf=smd TD opt  计算含Fe配合物激发态,主要是研究荧 ...

您好 请问您这个研究荧光猝灭是从哪几个方面考虑的哦,方便介绍一下或者推荐几篇文章么,我google了很久,找不到相关的计算文章

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发表于 Post on 2018-11-13 21:23:18 | 只看该作者 Only view this author
老师,查看LMO轨道的成分,发现如下:
Orbital:   39 Energy(a.u.):   -0.42690331 Occ:    2.00000000 Type: Alpha&Beta
Basis Type    Atom    Shell     Local       Cross term      Total
  151   S       14(H )   77      3.20920%      6.41699%      9.62619%
  152   S       14(H )   78      9.73036%     25.69446%     35.42482%
  160   S       15(Cu)   84     15.22103%     11.26951%     26.49054%
  172   X       15(Cu)   90      1.39187%      2.63588%      4.02775%
  196   S       16(Ni)   98      5.45991%      0.19608%      5.65599%
  208   X       16(Ni)  104      1.21829%      1.55756%      2.77585%
  209   Y       16(Ni)  104      1.32097%      3.29611%      4.61709%
Sum up those listed above:      37.55164%     51.06658%     88.61822%
Sum up all basis functions:     46.48386%     53.51614%    100.00000%
结果中,Cu和H的好说组分,但是Ni的轨道S,P都有,这怎么分析,可以认为是3 center键吗?老师能不能给几篇分析成键情况的文献?谢谢老师!

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发表于 Post on 2018-11-13 23:51:19 | 只看该作者 Only view this author
柒月小鱼 发表于 2018-11-13 15:15
您好 请问您这个研究荧光猝灭是从哪几个方面考虑的哦,方便介绍一下或者推荐几篇文章么,我google了很久 ...

在我和你共同在的群里 私聊我
恍惚月余,深谙人与人之间的差距。以后还应努力学习,才能与强者比肩。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-11-14 04:36:38 | 只看该作者 Only view this author
erya123 发表于 2018-11-13 21:23
老师,查看LMO轨道的成分,发现如下:
Orbital:   39 Energy(a.u.):   -0.42690331 Occ:    2.00000000 Ty ...

这没有什么难分析的,就是说这个LMO少量离域到Ni那边去,Ni的s和p轨道都有微量参与
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发表于 Post on 2018-11-14 13:18:56 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 哇哇吐 于 2018-11-14 23:40 编辑

老师您好,看了您用Multiwfn做电子空穴分析和NTO分析的博文,有一个问题想请教一下,博文中的例子是在优化后的基态结构下,做td(nstates=N)对N个单重激发态(非弛豫)做分析,请问如果分析三重态T1,T2呢,是在基态结构下做td(triplet,nstates=N)么?还是在优化好的T1,T2的结构下做td(nstates=N)?                                                  (更新)老师我说一下我的理解,以S0为参考态做td(nstates=N)/td(triplet,nstates=N)得到的是吸收的特征,以激发态为参考态做td得到的是发射的特征,对么?                                              (更新)老师,我在s0 的基础上 #p b3lyp/6-31g(d) scrf=(solvent=dichloromethane) td(nstates=5) IOp(9/40=4),和在S1的基础上 #p b3lyp/6-31g(d) scrf=(solvent=dichloromethane) td(nstates=5) IOp(9/40=4) 对第一个态做空穴电子分析,得到的结果显示各种指数有一点差别,但是做出的图来肉眼看不出差别。            


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发表于 Post on 2018-11-15 12:26:43 | 只看该作者 Only view this author
老师,multwfn做出的LMO轨道的d轨道之间的空间位置还会和原子的d轨道之间的空间位置(dxz和dxy相互垂直)一样保持吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-11-15 12:30:17 | 只看该作者 Only view this author
lily19830130 发表于 2018-11-15 12:26
老师,multwfn做出的LMO轨道的d轨道之间的空间位置还会和原子的d轨道之间的空间位置(dxz和dxy相互垂直)一 ...

LMO之间都是正交的。如果有两个LMO分别正好对应两个d原子轨道,那么这两个LMO肯定也是“垂直”的
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-11-15 12:31:25 | 只看该作者 Only view this author
哇哇吐 发表于 2018-11-14 13:18
老师您好,看了您用Multiwfn做电子空穴分析和NTO分析的博文,有一个问题想请教一下,博文中的例子是在优化 ...

用什么结构看你具体想讨论什么
诸如你想讨论从T1发磷光的跃迁情况,就应该用优化后的T1结构分析
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发表于 Post on 2018-11-15 17:20:03 | 只看该作者 Only view this author

请教:在用CCSD(T)做单点计算时,log老出错

请教个问题:高斯软件下,用CCSD(T)做单点计算时,关键词为“#p ccsd(t)/aug-cc-pvdz”,   输出文件 log老出错:
**** Warning!!: The largest alpha MO coefficient is  0.16344625D+03

Leave Link  801 at Wed Nov 14 12:38:41 2018, MaxMem=  1048576000 cpu:         3.6
(Enter /lustre/software/g09/l804.exe)
Closed-shell transformation, MDV=  1048576000 ITran=4 ISComp=1.
Semi-Direct transformation.
ModeAB=           4 MOrb=            59 LenV=    1036750157
LASXX=   8631960662 LTotXX=  8631960662 LenRXX= 17302502250
LTotAB=  8670541588 MaxLAS=  9660064336 LenRXY=           0
NonZer= 25934462912 LenScr= 52072342016 LnRSAI=  9660064336
LnScr1= 19395898880 LExtra=    33296809 Total=  98464104291
MaxDsk=137438953472 SrtSym=           T ITran=            4
DoSDTr:  NPSUse=  8
JobTyp=0 Pass  1:  I=   1 to  59.
Complete sort for first half transformation.
First half transformation complete.
Begin second half transformation for I=  10.
Erroneous write. Write -1 instead of 2695168.
fd = 4
orig len = 8384512 left = 2695168
g_write


遇到这问题该咋解决呢?
谢谢。

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