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[GROMACS] 运行过程出现Warning:质量和原子(范德瓦尔斯)半径将根据原子名称确定……

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错误提示如图,不知道是什么原因造成的:请问这个错误可以忽略吗?
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发表于 Post on 2018-5-31 19:56:25 | 只看该作者 Only view this author
这是因为根据当前输入文件,gmx没法准确获得元素信息,于是gmx就根据原子名、残基名试图去猜各个原子的元素,从而获得质量和范德华半径信息
看输出的文件,如果都猜对了就没问题
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-6-1 09:10:42 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-5-31 19:56
这是因为根据当前输入文件,gmx没法准确获得元素信息,于是gmx就根据原子名、残基名试图去猜各个原子的元素 ...

嗯嗯,谢谢sobereva老师。请问那怎么知道猜没猜对呢?
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发表于 Post on 2018-6-2 00:05:05 | 只看该作者 Only view this author
青青青 发表于 2018-6-1 09:10
嗯嗯,谢谢sobereva老师。请问那怎么知道猜没猜对呢?

你看都输出了什么文件,其中文本形式的,直接打开看看就知道
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-6-2 15:37:44 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-6-2 00:05
你看都输出了什么文件,其中文本形式的,直接打开看看就知道

受教了,谢谢您!
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