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[GROMACS] 求助,如何分析冰的生长速率

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楼主
大佬们,我做了一个冰水混合溶液,然后想分析冰的生长速率,看文献看到可以分析某一时刻的密度,rmsd,F4/F3等来看固液界面,但是我想观测这个冰的生长速率,请问各位大佬有什么方法吗

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发表于 Post on 2023-4-16 14:00:58 | 只看该作者 Only view this author
比如写个脚本,根据一定规则判断各个氧是属于水相还是冰相,然后绘制属于冰相的氧的数目随时间变化图,斜率就是生长速率
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发表于 Post on 2023-4-16 17:46:25 | 只看该作者 Only view this author
给你讲个简单,不正规,但正确的方法。F3/F4序参数变化的速率,就是水变成冰的速率
又菜又爱玩

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