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[波函数分析交流] 自然跃迁轨道(NTO)相对于电子-空穴分析的优势在哪?

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在阅读跃“迁密度分析方法-自然跃迁轨道(NTO)简介”(http://sobereva.com/91)之后,感觉分析分子的跃迁行为时,NTO分析的优势几乎完全被电子-空穴分析涵盖住了。不仅在简并时无法很好地描述跃迁,计算相对来说还是比较麻烦。
NTO分析是否有什么不可替代的优势呢?

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发表于 Post on 2018-1-12 09:34:30 | 只看该作者 Only view this author
让你变成回忆 发表于 2018-1-11 19:19
sob老师的“用Multiwfn做NTO分析”的博文里讲得很清楚了。
如果想要得到图中这样比较好看的图,得Multiw ...

谢谢您!

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发表于 Post on 2018-1-12 08:54:57 | 只看该作者 Only view this author
让你变成回忆 发表于 2018-1-11 19:19
sob老师的“用Multiwfn做NTO分析”的博文里讲得很清楚了。
如果想要得到图中这样比较好看的图,得Multiw ...

好的,谢谢您的提点!我们再按照sob老师和您说的研究多试试,谢谢!

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发表于 Post on 2018-1-11 19:19:37 | 只看该作者 Only view this author
qianbao 发表于 2018-1-11 18:42
老师您好,非常感谢您的指点。再想咨询您,我想做这样的NTO也是跟您发的帖子的步骤是一样的吗?

sob老师的“用Multiwfn做NTO分析”的博文里讲得很清楚了。
如果想要得到图中这样比较好看的图,得Multiwfn结合VMD来绘制。也有同样的帖子教你怎样绘制。

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发表于 Post on 2018-1-11 19:02:29 | 只看该作者 Only view this author

那请问老师,这张图也是用Multiwfn输出的吗?我现在输出的都是原子贡献的一些数据。

dislin.png (287.17 KB, 下载次数 Times of downloads: 52)

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发表于 Post on 2018-1-11 18:46:32 | 只看该作者 Only view this author
qianbao 发表于 2018-1-11 18:42
老师您好,非常感谢您的指点。再想咨询您,我想做这样的NTO也是跟您发的帖子的步骤是一样的吗?

一样
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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发表于 Post on 2018-1-11 18:42:03 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-1-11 11:05
仔细阅读
使用Multiwfn做自然跃迁轨道(NTO)分析
http://sobereva.com/377

老师您好,非常感谢您的指点。再想咨询您,我想做这样的NTO也是跟您发的帖子的步骤是一样的吗?

1515667235(1).jpg (195.01 KB, 下载次数 Times of downloads: 153)

1515667235(1).jpg

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发表于 Post on 2018-1-11 11:05:32 | 只看该作者 Only view this author
qianbao 发表于 2018-1-11 08:42
老师您好,弱弱地问您一下,计算NTO的输入文件是将td.out文件转换为gjf文件吗?
关键词是这样的:# cam-b3 ...

仔细阅读
使用Multiwfn做自然跃迁轨道(NTO)分析
http://sobereva.com/377
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发表于 Post on 2018-1-11 08:42:41 | 只看该作者 Only view this author
老师您好,弱弱地问您一下,计算NTO的输入文件是将td.out文件转换为gjf文件吗?
关键词是这样的:# cam-b3lyp/6-31g(d) pop(saveNTO,NTO) density=transition=1
camb3lyp/6-31g(d)是我的界面优化的泛函和基组。
谢谢老师!

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发表于 Post on 2015-5-7 20:36:20 | 只看该作者 Only view this author
虎王 发表于 2015-5-7 19:53
从准确性来说,是否相差无几?


没法说谁更准确。本来原子空间也没有唯一的定义。用哪个都可以,都是合理的。
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发表于 Post on 2015-5-7 19:53:57 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-5-7 16:49
主功能15模糊空间分析默认是Becke划分,你也可以用选项-1改成Hirshfeld划分。

从准确性来说,是否相差无几?

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发表于 Post on 2015-5-7 16:49:59 | 只看该作者 Only view this author
虎王 发表于 2015-5-7 14:37
好的,已经试过了。那么,这个“对电子或空穴分布进行定量分析考察每个原子的贡献”,其中的贡献是更接近 ...

主功能15模糊空间分析默认是Becke划分,你也可以用选项-1改成Hirshfeld划分。
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发表于 Post on 2015-5-7 15:06:30 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-4-23 14:34
最简单的就是直接用记录了NTO轨道的fch文件照常做轨道成分分析。
也可以对“电子”或者“空穴”分布进 ...

“ % of sum  ”这一列的数据总和总为100,似乎不需要再归一化了。

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发表于 Post on 2015-5-7 14:37:34 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-4-23 14:34
最简单的就是直接用记录了NTO轨道的fch文件照常做轨道成分分析。
也可以对“电子”或者“空穴”分布进 ...

好的,已经试过了。那么,这个“对电子或空穴分布进行定量分析考察每个原子的贡献”,其中的贡献是更接近于轨道组成分析的Hirshfeld方法还是NAO方法还是Mulliken方法?

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发表于 Post on 2015-4-23 14:34:42 | 只看该作者 Only view this author
虎王 发表于 2015-4-23 13:28
如果做了一系列化合物的“电子-空穴分析”后,想定量比较某类原子在激发态中的组成,是否有办法实现?
...


最简单的就是直接用记录了NTO轨道的fch文件照常做轨道成分分析。
也可以对“电子”或者“空穴”分布进行定量分析考察每个原子的贡献,只不过步骤多一些。具体来说,就是先导出电子或空穴的.cub文件,然后再将settings.ini里的iuserfunc设为-1(此时用户自定义函数就对应于根据cube文件插值出的函数),然后把cub文件载入Multiwfn,进入主功能15模糊空间分析,选1对指定函数在各个原子空间中进行积分,然后选100用户自定义函数,就可以看到每个原子对这个cube文件所记录的函数的贡献了。如果cube文件格点不够精细,可能原子贡献之和偏离100%多一些,可以自行归一化。
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发表于 Post on 2015-4-23 13:28:48 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-4-8 00:14
NTO的好处是保留了相位的概念,这样基于NTO轨道也可以计算跃迁性质。
另外对于指认一些激发类型有用,比如 ...

如果做了一系列化合物的“电子-空穴分析”后,想定量比较某类原子在激发态中的组成,是否有办法实现?
例如比较S1态中金属的贡献。

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