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使用了Sob编写gau_xtb程序的JACS文章——吡喃酮类新型生物合成机制:周环反应分叉

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本帖最后由 zsu007 于 2021-7-27 12:43 编辑

请看X-Mol资讯   
吡喃酮类新型生物合成机制:周环反应分叉现象

  https://www.x-mol.com/news/687627  

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发表于 Post on 2024-9-19 15:54:13 | 只看该作者 Only view this author
科研思路真是妙!

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发表于 Post on 2021-7-28 14:18:06 | 只看该作者 Only view this author
K.N.HOUK组本来就属于计算领域的大佬,审稿人也很难去质疑他们所用的计算方法, 比如他们组一直用CPCM的溶剂模型,最近一两年都用wB97X-D泛函去算。不过他们揭示的机制都很新,找些特色 特点去学习

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发表于 Post on 2021-7-28 12:41:27 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2021-7-28 11:44
此类课题较新,研究手段不是那种简单找找过渡态、算算反应能垒。在被大家学会整个套路灌水前,计算级别不 ...

了解了,老师
Change isn't just a slogan. It begins with hard work.

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发表于 Post on 2021-7-28 11:44:38 | 只看该作者 Only view this author
zx4562430 发表于 2021-7-28 11:02
我记得TIP3P在MD中不是非常好的水模型,gaussian中的水模型ief-PCM和SMD是最好的,这个文章是不是应该采用 ...

此类课题较新,研究手段不是那种简单找找过渡态、算算反应能垒。在被大家学会整个套路灌水前,计算级别不是那么重要,揭示insight更为重要。
自动做多参考态计算的程序MOKIT

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发表于 Post on 2021-7-28 11:31:44 | 只看该作者 Only view this author
Houk组是不是有哪位中国人带过去了不少社长的程序,最近看他们用sobMECP之类的。

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发表于 Post on 2021-7-28 11:02:12 | 只看该作者 Only view this author
我记得TIP3P在MD中不是非常好的水模型,gaussian中的水模型ief-PCM和SMD是最好的,这个文章是不是应该采用更好的水模型呢?
Change isn't just a slogan. It begins with hard work.

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发表于 Post on 2021-7-28 10:22:05 | 只看该作者 Only view this author
又是K.N.HOUK组的发的JACS,他们组quasiclassical MD,ambimodal TS,Diels−Alder反应,周环反应都属于他们组长期进行的相关课题和技术手段了,
这一套学会了很快,同时跟 也是UCLA的Yi Tang实验合作,挖掘天然产物或者酶催化反应,发文章太猛了

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发表于 Post on 2021-7-27 12:47:11 来自手机 | 只看该作者 Only view this author
又见绿巨人 :D

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