讨论下MS中MESOCITE模块？

zyj19831206

看了看MATERIALS STUDIO 8.0,其中有个最大的改动就是DPD模块没有，只剩下了mesocite和mesodyn模块，并且传说中的mesoprop模块也是只闻其名，不见其声音，是不是介观模拟以后也会朝着粗粒化力场动力学方向发展？

lazarus

想问一下大家会不会使用mesocite模块建立这种模型

牧生

我看过创腾的mesocite教程讲义，没有任何一点有用的东西。基本就是广告宣传，把一些文献中的图搬过来讲一下而已。
完全没有讲任何关于调参数的方法，比如，mesocite里面可以非常方便的粗粒化十六烷基三甲基氯化铵阳离子部分，这部分的参数是内置的。但是，遇上甲苯就不行了，没有内置参数，需要自己输入，但初学者也不容易搞好这一步。

mesocite里面也不自带抗冻水，只有普通的粗粒化的水，很容易结冰（这个是网上说的，我自己没有遇到）
gromacs用GPU加速跑全原子挺快的，完胜mesocite百倍。即使因为体系太大，不得不用粗粒化，也可以考虑martini力场，还能GPU加速。从任何一方面来看，mesocite都没有价值。

zyj19831206

sobereva 发表于 2015-9-19 14:03
DPD模块去掉的原因，大抵是因为mesocite本身就能做DPD，而且我觉得更好用，所以DPD模块就没必要存在了。我 ...

感觉mesocite 的文章还不算太多，感觉又找到一个灌水的方向，只是网络上mesocite 的资料实在太少，tutorials里面的资料也是摸凌两可，真是不好办，我觉得对于聚合物，forcite和mesocite都可以挖掘出很多好东西，这两个模块的高级教程不多。

sobereva

DPD模块去掉的原因，大抵是因为mesocite本身就能做DPD，而且我觉得更好用，所以DPD模块就没必要存在了。我倒不觉得反映出理论上的趋势。