VASP切面扩胞的求助

朱陈 · 发表于 Post on 2020-3-18 20:36:03

请教各位老师，我最近看了一些vasp表面催化计算的文章，对切面扩胞有些疑问。文献里有用primitive切面扩胞，有的是用
conventional，我现在的理解是任何一种都可以，只要晶胞有足够的空间容纳被吸附物。不知道我的理解对不对，还是有一定
的讲究。还望各位老师不吝指教，先谢了！

朱陈 · 发表于 Post on 2020-3-23 10:58:49

ghifi37 发表于 2020-3-22 21:38
看起来挺正常的，只不过左边跑右边而已，周期性的，等价

非常感谢

朱陈 · 发表于 Post on 2020-3-23 10:58:36

卡开发发发表于 2020-3-22 21:59
周期性的原因，不用担心。

谢谢老师的指导

卡开发发 · 发表于 Post on 2020-3-22 21:59:20

朱陈发表于 2020-3-22 21:27
老师，这是优化前后的结构，优化后的结构原子改变的位置我用红色标记了。麻烦老师您看一下，谢谢

周期性的原因，不用担心。

ghifi37 · 发表于 Post on 2020-3-22 21:38:00

朱陈发表于 2020-3-22 21:27
老师，这是优化前后的结构，优化后的结构原子改变的位置我用红色标记了。麻烦老师您看一下，谢谢

看起来挺正常的，只不过左边跑右边而已，周期性的，等价

朱陈 · 发表于 Post on 2020-3-22 21:27:27

卡开发发发表于 2020-3-22 21:10
要不优化前优化后的结构上图看看，现在判断不了。

老师，这是优化前后的结构，优化后的结构原子改变的位置我用红色标记了。麻烦老师您看一下，谢谢

朱陈 · 发表于 Post on 2020-3-22 21:23:41

ghifi37 发表于 2020-3-22 21:03
有多大的真空层？

15的真空，4层

卡开发发 · 发表于 Post on 2020-3-22 21:10:59

朱陈发表于 2020-3-22 20:57
谢谢老师的指点，老师我还有一个问题想麻烦您，我在优化p(4*3）晶胞时，表面的原子位置发生了改变，从一 ...

要不优化前优化后的结构上图看看，现在判断不了。

ghifi37 · 发表于 Post on 2020-3-22 21:04:05

朱陈发表于 2020-3-22 20:57
谢谢老师的指点，老师我还有一个问题想麻烦您，我在优化p(4*3）晶胞时，表面的原子位置发生了改变，从一 ...

有多大的真空层？

ghifi37 · 发表于 Post on 2020-3-22 21:03:58

朱陈发表于 2020-3-22 20:57
谢谢老师的指点，老师我还有一个问题想麻烦您，我在优化p(4*3）晶胞时，表面的原子位置发生了改变，从一 ...

有多大的真空层？

朱陈 · 发表于 Post on 2020-3-22 20:57:17

卡开发发发表于 2020-3-19 19:26
可以，但晶面指数一般应该是按照conventional定义的。原则上也可以根据吸附物容纳的情况、覆盖度这些来对表 ...

谢谢老师的指点，老师我还有一个问题想麻烦您，我在优化p(4*3）晶胞时，表面的原子位置发生了改变，从一个面到了对称的面，任务也是正常结束。这个大概是什么原因造成了，是因为周期性的缘故吗。谢谢老师了

卡开发发 · 发表于 Post on 2020-3-19 19:26:48

可以，但晶面指数一般应该是按照conventional定义的。原则上也可以根据吸附物容纳的情况、覆盖度这些来对表面的晶格矢量进行任意线性组合。

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[VASP] VASP切面扩胞的求助