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[综合交流] 怎样通过分子模拟的方法得到一个体系的熵

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怎样通过分子模拟的方法得到一个液相体系的熵?是否可以实现?

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发表于 Post on 2017-11-6 14:03:52 | 只看该作者 Only view this author
这个算是自由能计算的前沿问题了

得到一个体系的熵肯定是不行的(也没有意义),只能得到一个过程的熵变,或者两个状态的熵变

现在最准确的方法是在不同温度下算两次PMF,然后用dS=dG/dT来求

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发表于 Post on 2017-12-11 10:16:43 | 只看该作者 Only view this author
不好意思,我想问下,用高斯09怎么计算熵校正值呢?

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发表于 Post on 2017-12-11 14:36:07 | 只看该作者 Only view this author
qxx 发表于 2017-12-11 10:16
不好意思,我想问下,用高斯09怎么计算熵校正值呢?


谈谈谐振频率校正因子
http://sobereva.com/221
这和此帖主题完全不相关
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发表于 Post on 2017-12-13 15:33:19 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-12-11 14:36
谈谈谐振频率校正因子
http://sobereva.com/221
这和此帖主题完全不相关

谢谢老师,不好意思sob老师,下次不会了

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发表于 Post on 2017-12-15 17:19:30 | 只看该作者 Only view this author
倒是有方法可以估算 Conformational entropy,使用Normal Mode Analysis的方法来计算,但是是基于系统能量势垒是Harmonic的假设。

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