求助，使用Gaussian优化六水合锌离子结构后配位键消失

Wxl0112

各位老师好，我是刚开始学习Gaussian的小白，如果有低级问题希望多多批评指出。我用Gaussian对六水合锌离子，六水合铝离子的结构进行优化，优化完之后发现铝离子的看着没啥问题，但是水合锌离子的配位键都消失了，想问问各位老师是怎么回事

乐平

又是老生常谈的问题。
任何量子化学软件（Gaussian, ORCA）和第一性原理计算软件（VASP, CASTEP, CP2K, Quantum Espresso）的计算结果在图形显示的情况下“显示”的所谓化学键只不过是连接方式而已，根本就不是化学键。不要被眼睛看到的东西给蒙蔽了。

说得更极端一些，世界上根本没有化学键这种物质，它也不是物理量。化学键是化学家为了方便解释原子之间如何组成分子，如何构成晶体形象化出来的假想体。它本身在实验中是测量不到的。能测量的只是原子距离，键能这些物理量。

图形软件（GaussView）显示的只不过是原子间的连线而已。本质上，你需要测量原子之间的距离，这才是关键。图形软件是根据距离的大小来连线，仅此而已。

所以，你所谓的结构优化之后离子键不见了，只不过是因为优化之后 Zn 离子与氧原子之间的距离稍稍增大了一些，超出了 GaussView 默认的连线距离，仅此而已。不要害怕。

你用测量工具量一下 Zn-O 的距离就行。如果实在看着不顺眼，顺手连起来就行。

至于如何判断是否“成键”，可以阅读社长的帖子
谈谈原子间是否成键的判断问题
http://sobereva.com/414（http://bbs.keinsci.com/thread-9840-1-1.html）

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题外话，对应经典分子动力学软件（LAMMPS, GROMACS）是需要指定“化学键”的。这是因为它们都是基于经典牛顿力学的软件，不是基于量子力学，需要人为去设置原子间的相互作用力，也就是力场，势函数。所有，经典动力学软件没法描述化学反应（没有所谓化学键的断裂和生成）。除非是反应型力场（依旧需要指定化学键），但是反应型力场的适用范围相对狭窄，没有量子化学或第一性原理计算软件那么“灵活”。

Wxl0112

乐平 发表于 2025-8-20 10:59
又是老生常谈的问题。
任何量子化学软件（Gaussian, ORCA）和第一性原理计算软件（VASP, CASTEP, CP2K, Qu ...

好的好的，谢谢老师，我认真看一下社长的帖子先