吸附计算的一些疑问?

liu_tiao

第一个问题：吸附计算之后，如何判断吸附分子和表面原子是否成键了呢，根据文献和吸附能是正数，（吸附前能量减去吸附后能量），应该是成键了的。但是我的建模工具在有的吸附构型的时候没显示成键。我看了一下，可能成键原子之间距离在0.26nm左右。第二个问题：计算的是ABCDE五种分子，他们都有稳定的构型（吸附能+0.3~0.6 eV），吸附能大小为A<B<C<D；但是因为空间位阻，CDE还有不稳定的构型（吸附能-0.2 eV）；实验中观测到的反应速率为A>B>C>D>E。这里不知道应该怎么解释。
因为正在写小论文和毕业论文，求大神指导一下。免得数据处理和分析的不太严谨。

jiewei

判断吸附分子和表面原子是否成键了呢:
1） 键长判定法
2）结合能判定法（注意结合能指优化后的AB能量减去在AB中A以及B的能量，其中A和B不再优化，能量约大于2eV 可认为成半键以上）
3）电子密度差法： 成键的原子之间的电子密度差具有明显的成键特性（排斥为主，且范围较大，等值面较大），而物理吸附等值面小且展示出部分电子聚集效应。
4）键级判定法。

lc00

jiewei 发表于 2016-11-10 09:11
判断吸附分子和表面原子是否成键了呢:
1） 键长判定法
2）结合能判定法（注意结合能指优化后的AB能量减去 ...

键长判定法，一般键长在什么范围之间，就可以认为成键了呢？

卡开发发

建模工具显示的是否成键没啥实际用场，这类问题没少被人吐槽http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 3&highlight=CCL，判断标准你可以参考@jiewei兄的4点。

键长方面的比较可以以两原子共价半径/金属半径之和做参考，当然这只是参考，不能作为充分的标准。比较合理的半定量方式还是借助电子结构分析的方法比较好，如AIM等。

反应速率与吸附能的因果关系是？产物的吸附能大也有可能导致脱附困难。

liu_tiao

卡开发发 发表于 2016-11-10 09:59
建模工具显示的是否成键没啥实际用场，这类问题没少被人吐槽http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthr ...

是啊，卡哥，吸附能和反应活性没有直接的联系。只能尽量用算出来的吸附能规律，来解释一下反应活性了。