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[GROMACS] 想模拟低共熔溶剂+水体系,水模型选用哪个比较合适呢?

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想模拟低共熔溶剂+水体系,水模型选用哪个比较合适呢?

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发表于 Post on 2021-7-5 16:43:41 | 只看该作者 Only view this author
opc水模型
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发表于 Post on 2021-7-5 18:29:45 | 只看该作者 Only view this author
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并清楚反映出帖子具体内容,避免有任何歧义,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题“水模型的选取”改了,以后务必注意

之前http://bbs.keinsci.com/thread-23825-1-1.html里我就已经提醒过你一次,如果下次发帖标题还违规,我就要严厉处理了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-7-5 21:41:09 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-7-5 18:29
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此 ...

好的老师,以后一定严谨。
老师如果我想在原有的低共熔溶剂盒子(packmol创建的)中加入250个OPC水分子,应该怎么操作呢?

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发表于 Post on 2021-7-6 00:49:49 | 只看该作者 Only view this author
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发表于 Post on 2021-7-6 07:47:41 | 只看该作者 Only view this author
二饼妹 发表于 2021-7-5 21:41
好的老师,以后一定严谨。
老师如果我想在原有的低共熔溶剂盒子(packmol创建的)中加入250个OPC水分子 ...

gmx solvate结合-cs tip4p.gro -maxsol 250
或者直接用packmol插入
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-7-6 09:58:37 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-7-6 07:47
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或者直接用packmol插入

谢谢老师!

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