求助：如何获取无机盐水溶液的冰水合物的cif结构文件？

邱美佳 · 发表于 Post on 2021-5-2 17:57:45

请问如何获取无机盐水溶液在低温下结冰得到的冰水合物的结构文件啊。我在网上查到的都是冰和甲烷水合物的结构，其他的好难找，有没有什么网站推荐？

sobereva · 发表于 Post on 2021-5-2 18:01:31

这个不太可能有，因为这种体系的结构一般都是无序的，不是周期性重复的
要得到这种结构自己跑MD就完了

邱美佳 · 发表于 Post on 2021-5-2 20:48:04

sobereva 发表于 2021-5-2 18:01
这个不太可能有，因为这种体系的结构一般都是无序的，不是周期性重复的
要得到这种结构自己跑MD就完了

卢老师，请问这种盐水体系用gromacs是不可能模拟出结冰的效果是吗

牧生 · 发表于 Post on 2021-5-2 21:32:07

本帖最后由牧生于 2021-5-2 21:53 编辑

邱美佳发表于 2021-5-2 20:48
卢老师，请问这种盐水体系用gromacs是不可能模拟出结冰的效果是吗

可以模拟结冰的

http://bbs.keinsci.com/thread-21676-1-1.html 9楼

邱美佳 · 发表于 Post on 2021-5-3 09:53:24

牧生发表于 2021-5-2 21:32
可以模拟结冰的

http://bbs.keinsci.com/thread-21676-1-1.html 9楼

请问你的压力和温度是多大呢？我是零下100度，压力450bar，模拟了400ns 水一点都没有结冰的迹象。纯水倒是很容易就全都结冰了。

牧生 · 发表于 Post on 2021-5-3 11:50:23

邱美佳发表于 2021-5-3 09:53
请问你的压力和温度是多大呢？我是零下100度，压力450bar，模拟了400ns 水一点都没有结冰的迹象。纯水倒 ...

我做的纯水很不容易结冰。但是加入冰晶的冰水混合物很容易结冰。。

再者，不是很建议一来就设置为零下100度，因为迅速超低温，容易使得水变成无定形冰，从而看不出漂亮的晶体形状。试试零下10度呢

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