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[GROMACS] 实验是在超声环境下进行的,该怎么模拟?

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楼主
请问在超声波清洗机里进行的实验,在模拟的时候该怎么解决超声问题?使用的Gromacs,OPLS力场。

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发表于 Post on 2019-4-12 15:48:55 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 jase20 于 2019-4-12 16:03 编辑

之前看到过一篇文章也是模拟过超声,他是用正弦波式的压力来模拟的https://pubs.acs.org.ccindex.cn/doi/10.1021/ja502749f
或许对你有帮助

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-12 16:44:57 | 只看该作者 Only view this author
jase20 发表于 2019-4-12 15:48
之前看到过一篇文章也是模拟过超声,他是用正弦波式的压力来模拟的https://pubs.acs.org.ccindex.cn/doi/10 ...

我先下来研究下,谢谢

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发表于 Post on 2019-4-12 16:59:57 | 只看该作者 Only view this author
取决于超声在其中起了什么作用,如果是改变压强的话,设置一个正弦变化的压强就行,如果是产生气泡的话,就需要手动生成这些气泡

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-12 18:20:15 | 只看该作者 Only view this author
fhh2626 发表于 2019-4-12 16:59
取决于超声在其中起了什么作用,如果是改变压强的话,设置一个正弦变化的压强就行,如果是产生气泡的话,就 ...

在三口烧瓶里进行的反应,瓶口就简单的用塑料薄膜封了下,这样压强应该变化不大;超声频率影响最终产物的形貌,应该起机械作用吧,要怎么设置呐?

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发表于 Post on 2019-4-12 19:48:30 | 只看该作者 Only view this author
万年流星 发表于 2019-4-12 18:20
在三口烧瓶里进行的反应,瓶口就简单的用塑料薄膜封了下,这样压强应该变化不大;超声频率影响最终产物的 ...

压强与超声的正弦波特性有关,不是指气压

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-13 10:50:02 | 只看该作者 Only view this author
fhh2626 发表于 2019-4-12 19:48
压强与超声的正弦波特性有关,不是指气压

那我这个是要改变正弦压强吗

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