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[CP2K] cp2k算纯气相体系,有没有跑aimd的文献(例子)

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楼主
最近想用cp2k跑一下纯气相体系,就类似于氢气和氧气反应生成水(水在这个时候按照我的理解是气相条件下的),不知道大家有没有见过cp2k算气相体系的文章,可否提供一下,不胜感激!

之前用cp2k算凝聚态(液态和固态),也知道cp2k在算凝聚态方面有优势,但是根据官方的解释是,cp2k是可以算气相下的物质的。

查阅了一些文献,涉及到cp2k算气相体系的物质的时候,往往都是吸附性计算或者催化计算,就是在这个体系中有凝聚相物质占大多数,气体占少数,暂时我还没有发现用cp2k算纯气相体系的例子,因此想找请教一下各位老师。

最后,其实我是发现了一篇文章(见附件)和纯气相有一丢丢相关的,不过它体系实在是太小了(十几个原子),而且主要是算的光谱,我想要的是通过跑气相条件下的aimd以此来观测轨迹文件中的化学反应历程。

可能cp2k算纯气相体系并没有其他的程序好,或者有什么好的程序也恳请各位老师推荐一下。

万分感激

2014gas.pdf

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发表于 Post on 2022-5-27 21:03:35 | 只看该作者 Only view this author
纯气相MD比较适合用orca,起码不比CP2K差,至于是不是比CP2K好我就不是太清楚了,起码从用的人数来说应该用的比CP2K多
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2022-5-27 21:39:44 | 只看该作者 Only view this author
除非算那些原子堆积得非常紧密而且很大的团簇,否则用CP2K算相对于用ORCA只有坏处没有好处。诸如你研究的这种体系,用CP2K跑AIMD效率远低于用ORCA跑AIMD,尤其是用杂化泛函时。所以你也很难找到CP2K算这类体系的文章。

小分子的气相反应的AIMD这类问题都通常建议用ORCA,看下面的例子
使用ORCA做从头算动力学(AIMD)的简单例子
http://sobereva.com/576http://bbs.keinsci.com/thread-20800-1-1.html
揭示各种新奇的碳环体系的振动特征
http://sobereva.com/578http://bbs.keinsci.com/thread-20919-1-1.html

能算周期性体系的程序一律都能算孤立分子,但相对于专门干这种事的量子化学程序来说,通常是严重不划算、不理想的。

标题里不要自己写[求助]这样的标签,此贴说了http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-27 22:57:04 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-5-27 21:39
除非算那些原子堆积得非常紧密而且很大的团簇,否则用CP2K算相对于用ORCA只有坏处没有好处。诸如你研究的这 ...

谢谢老师的解疑,以后发帖我一定注意规范

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-27 22:57:31 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-5-27 21:03
纯气相MD比较适合用orca,起码不比CP2K差,至于是不是比CP2K好我就不是太清楚了,起码从用的人数来说应该用 ...

谢谢老师的回答

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发表于 Post on 2025-3-17 16:47:53 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-5-27 21:39
除非算那些原子堆积得非常紧密而且很大的团簇,否则用CP2K算相对于用ORCA只有坏处没有好处。诸如你研究的这 ...

其实我有个疑问,因为气相的MD因为要模拟反应进行,那么周期性很可能是PPP,这种情况下用cp2k和ORCA或者高斯会有很大差别吗?我不是很理解其中区别。如果cp2k算的话是不是需要额外进行一些设置呢

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发表于 Post on 2025-3-17 18:46:50 | 只看该作者 Only view this author
Divergence 发表于 2025-3-17 16:47
其实我有个疑问,因为气相的MD因为要模拟反应进行,那么周期性很可能是PPP,这种情况下用cp2k和ORCA或者 ...

我觉得取决于具体要研究的气相反应体系,对一两个小分子参与的过程(如3楼链接里提的那些)只用ORCA做非周期性计算即可,而对大量分子参与的燃烧、聚合等复杂过程才需要用CP2K按周期性计算。
√546=23.36664289109

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