请问Avogadro与Multiwfn显示的分子轨道不一样是为什么？

林俊杰

请问一下，用的同样的文件，为什么分子轨道不一样呢？

zjxitcc

不建议使用Avogadro可视化轨道，用它看看分子结构就得了。如果非要用，建议使用ORCA官方论坛修改版Avgadro，或者尝试Avogadro 2。

针对当前体系你的问题：Multiwfn可视化这个轨道是对的，Avogadro可视化这个结果是不对的。至于是Avogadro自身问题（没正确支持），还是您的问题（例如操作有误、格点过于粗糙、使用的Avogadro版本过低），凭当前信息无从判断，也不建议深究，时间宝贵。

如何验证：可以使用MOKIT的molden2fch小程序产生h2o.fch文件，即运行命令

1. molden2fch h2o.molden -orca

复制代码

该h2o.fch文件可以用GaussView或Multiwfn打开 可视化，第5号轨道就是O原子的孤电子对，垂直于水分子平面。

Uus/pMeC6H4-/キ

zjxitcc 发表于 2025-8-22 00:57
不建议使用Avogadro可视化轨道，用它看看分子结构就得了。如果非要用，建议使用ORCA官方论坛修改版Avgadro ...

小声说一句，从蓝色图标来看楼主那个才是Avogadro 2，我这里的1.100.1版Avogadro 2载入楼主的molden文件后也能复现同样的轨道编号及等值面图形的错误。反而是橙色图标的一代Avogadro的1.2.0版（并非ORCA enhanced version，据说其对应的ORCA版本太古老了）的显示结果更合理

不过Avogadro并不能识别molden文件里记录的轨道能量和对称性，所以并不影响“不建议用Avogadro可视化轨道”的结论。

说真的，Avogadro用户反馈问题应该到官方论坛去。楼主可以参考http://bbs.keinsci.com/thread-49847-1-1.html总结的ORCA的辅助工具。

sobereva

Multiwfn载入molden文件看轨道又极快又特别方便，最新版还支持鼠标拖动旋转，还能直接载入gbw文件（恰当设置settings.ini里orca_2mklpath的前提下），在我来看真没任何必要用Avogadro。需要更好图像效果还能Multiwfn导出cube文件后用VMD显示和渲染