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[蒙特卡罗] RASPA2测试运行一直出现Writing Crash-files!

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原安装包的一个example里是ITQ-12模拟丙烷的吸附,ITQ-12的cif和丙烷的propane.def是我补充进去的,运行simulat simulation.input就会出现Writing Crash-files!究竟是什么问题??

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发表于 Post on 2025-4-24 12:26:42 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 xyan11 于 2025-4-24 12:30 编辑

这个是正常的输出信息

simulation.input里第7行"WriteBinaryRestartFileEvery   1000"
这个就是命令每1000步写一个模拟存档点 万一模拟因为不可抗力退出了 你可以读取这个存档文件来继续跑模拟

Writing Crash-file! 后面的数字0-4000再到0是对应第三行"NumberOfInitializationCycles  5000"的5000个初始化步
后面从0-15000是采数据的15000步 对应第二行"NumberOfCycles                15000"


顺便多个嘴,你用的RASPA2版本似乎是numat的(https://github.com/numat/RASPA2) 有点老 很多年没有维护。

建议你用iRASPA的这个版本(https://github.com/iraspa/RASPA2)稍微新一点。

或者你有N卡GPU的话 可以试试gRASPA(https://github.com/snurr-group/gRASPA) 前一阵子发了JCTC(10.1021/acs.jctc.4c01058) 据说跑起来特别快

希望有所帮助

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-4-24 14:50:28 | 只看该作者 Only view this author
xyan11 发表于 2025-4-24 12:26
这个是正常的输出信息

simulation.input里第7行"WriteBinaryRestartFileEvery   1000"

是这样啊!非常感谢!我初学,也没有代码基础,用自己小破轻薄本跑,运行很久都没结束,以为没跑通。

新版的RASPA2有什么区别呢

还想请问一下就是,我拿到一批cif文件的话,该怎么批量准备input、pseudo atoms和力场相关的两个def文件呢。

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发表于 Post on 2025-4-24 17:03:36 | 只看该作者 Only view this author
新版本相对旧版本的变化:https://github.com/iRASPA/RASPA2/blob/master/ChangeLog.md

批量的话 可以用ASE来读取CIF文件 试试然后用这个接口https://github.com/Quantum-Accelerators/raspa_ase 在ASE里跑RASPA2

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