怎么用vmd复制并平移分子

Sunca · 发表于 Post on 2024-7-2 23:13:49

我想建成像图中一样的模型，作者文章里面说是用vmd复制平移得到的，平移我会，但是怎么复制呢？
或者有其他方法可以实现吗？求大佬指点

sobereva · 发表于 Post on 2024-7-3 08:54:58

没法平移复制
可以平移一次保存一次xyz文件，最后自行合并

dayu8278 · 发表于 Post on 2024-7-3 08:58:11

用pymol可以的

然后对目标实施平移，用命令，别手动，这样可以的，效果不错

乐平 · 发表于 Post on 2024-7-3 11:28:11

GaussView 可以

（1）建立其中一个模型
（2）在第一步的模型中间位置的原子上添加一个虚原子，然后复制第一步的模型。你会在主界面窗口的下方预览到模型结构，用鼠标选择模型中间的原子（和虚原子背对背的原子），选中之后它会黄色高亮。 再用鼠标点击建模窗口（也就是你模型所在的大窗口），在虚原子上点鼠标左键，这样连接的时候就会将高亮的原子和虚原子连在一起。
（3）调节虚原子和连接原子之间的距离，也就是你说的平移。
（4）重复第（2）步和第（3）步的操作

tjuptz · 发表于 Post on 2024-7-4 11:11:01

::TopoTools::mergemol {0 1 ...} 查一下这个命令

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register

[VMD] 怎么用vmd复制并平移分子