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[GROMACS] C12烷烃的拓扑和力场的问题

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楼主
有没有人写过C12的烷烃的拓扑啊,用的是什么力场,为什么用OPLS_AA力场出来的数据误差好大。。。

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发表于 Post on 2017-11-22 19:19:34 | 只看该作者 Only view this author
GROMOS最新版力场就很适合
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2017-11-23 02:27:39 | 只看该作者 Only view this author
这种分子trappe应该也不错

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-11-23 09:18:22 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-11-22 19:19
GROMOS最新版力场就很适合

我安的是16.04版的,能否把最新版的力场文件给我发一下,OPLS_AA力场的,谢谢,我的邮箱是1007572730@qq.com

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-11-23 09:19:15 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-11-22 19:19
GROMOS最新版力场就很适合

是gromacs吧?

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发表于 Post on 2017-11-25 13:38:58 | 只看该作者 Only view this author

gromacs是程序,gromos是gromacs御用的力场
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发表于 Post on 2017-11-25 13:39:23 | 只看该作者 Only view this author
zdy 发表于 2017-11-23 09:18
我安的是16.04版的,能否把最新版的力场文件给我发一下,OPLS_AA力场的,谢谢,我的邮箱是

最新版gromacs里直接自带了很新的gromos力场参数
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-11-27 09:46:38 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-11-25 13:39
最新版gromacs里直接自带了很新的gromos力场参数

哦哦,明白了

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