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[综合交流] 173个原子金属络合物结构优化的计算方法选择问题

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各位大神,我在做一个金属络合物的结构优化,老师说不简化直接计算,有173个原子(Ni,P,C,O,H),具体结构:Ni位于四面体中心,顶点为4个配体(见附件)。尝试用B3LYP/6-31g(d,p),结果算不动。使用PM6,也没有结果。对于这样的体系选择Gaussian中那些方法比较合适???
谢谢!
硬件:4G内存16核

下面是sob老师的帖子,给出的建议
不同尺度弱相互作用体系的最佳计算方法
1 >500个原子:PM6-D3H4结合MOZYME
2 >300个原子:BLYP D3 GCP(DFT/SVP) def2-SVP def2-SVP/J
3 >150个原子:BLYP D3 GCP(DFT/TZ) def2-TZVP def2-TZVP/J
4 >60个原子:BLYP D3 def2-QZVPP(-g,-f) def2-QZVPP/J
5 >40个原子:RI-PWPB95 D3 RIJCOSX def2-QZVPP(-g,-f) def2-QZVPP/J def2-QZVPP/C grid4 tightSCF(/J可改用/JK以减小密度拟合的误差)
6 二、三十个原子:RI-PWPB95 D3 RIJK def2-QZVPP def2-QZVPP/JK def2-QZVPP/C grid4 tightSCF
7 十几个原子:CCSD(T)/jul-cc-pVTZ或may-cc-pVQZ
8 <10个原子:CCSD(T)/CBS (aug-cc-pVTZ->QZ外推。想更精确再加上counterpoise校正,耗时将增加近2倍)

2-6用ORCA来做计算,列出的就是在ORCA中实际要写的关键词

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发表于 Post on 2017-8-24 11:21:37 | 只看该作者 Only view this author
由于是配合物,用BP86更合适一点。结合def2-SVP来优化即可
对于ORCA4.0来说就写BP86 def2-SVP def2/J opt
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2017-8-24 15:37:59 | 只看该作者 Only view this author
内存好小,着实建议去买两条,现在很便宜了

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发表于 Post on 2017-8-24 15:39:25 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-8-24 11:21
由于是配合物,用BP86更合适一点。结合def2-SVP来优化即可
对于ORCA4.0来说就写BP86 def2-SVP def2/J opt

最低等级的DFT方法里为什么不是def2-SV(P)基组,是不是有潜在的问题?

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发表于 Post on 2017-8-24 15:52:08 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2017-8-24 15:39
最低等级的DFT方法里为什么不是def2-SV(P)基组,是不是有潜在的问题?

帖子里那个是对弱相互作用计算而言的,没准会有不少氢键,比如算个巨大的水团簇,或者大分子+显式水模型。如果没有氢键可以用def2-SV(P),不过时间也省不了太多,毕竟氢的极化函数对耗时影响远不及重原子的极化那么大

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liyuanhe211 + 1 谢谢

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发表于 Post on 2017-8-25 10:03:50 | 只看该作者 Only view this author
给我高斯的计算文件,我可以帮你计算一下卡看,我的是24核心的电脑,你的配置太低了

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-8-26 09:46:31 | 只看该作者 Only view this author
yezhonghua 发表于 2017-8-25 10:03
给我高斯的计算文件,我可以帮你计算一下卡看,我的是24核心的电脑,你的配置太低了

这是linux上的输入文件,如果硬件允许,尝试B3LYP/6-31g(d,p),谢谢!

Ni-ML4.com

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-8-26 09:48:07 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-8-24 11:21
由于是配合物,用BP86更合适一点。结合def2-SVP来优化即可
对于ORCA4.0来说就写BP86 def2-SVP def2/J opt

谢谢老师,我试试!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-8-29 17:14:42 | 只看该作者 Only view this author
yezhonghua 发表于 2017-8-25 10:03
给我高斯的计算文件,我可以帮你计算一下卡看,我的是24核心的电脑,你的配置太低了

怎么样?有结果吗?谢谢!

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发表于 Post on 2017-8-30 08:47:48 | 只看该作者 Only view this author
lkk 发表于 2017-8-29 17:14
怎么样?有结果吗?谢谢!

稍等,计算中,上次没有投上

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发表于 Post on 2017-8-30 21:51:54 | 只看该作者 Only view this author
lkk 发表于 2017-8-29 17:14
怎么样?有结果吗?谢谢!

SCF未收敛,应该能计算

Ni-ML4.log

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-9-16 15:29:17 | 只看该作者 Only view this author
yezhonghua 发表于 2017-8-30 21:51
SCF未收敛,应该能计算

迟到的感谢!

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