CP2K进行高温高压的水层岩石表面反应的AIMD模拟的问题

user_fu · 发表于 Post on 2025-5-8 19:35:51

想请教一下各位老师，用cp2k做一个高温(200–300℃）高压(500bar）的水层岩石表面反应时，即岩石表面还原水分子，在ms建好水层与表面岩石的模型后，采用npt系综在高温高压下进行平衡，得到水层与表面的平衡结构后，如果想要进行限制性aimd模拟反应过程，是不是要切换到nvt体系下对反应进行模拟，以及如何评判平衡后水层与表面的正确接触，因为是第一次模拟这中反应因此比较生疏，如果对我的模拟过程有任何的建议，还请各位老师多多指导。

sobereva · 发表于 Post on 2025-5-9 02:20:13

如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示，求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问，并清楚、准确反映出帖子具体内容，避免有任何歧义和含糊性，仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “CP2K进行AIMD模拟” 改了，以后务必注意！下次将删帖+扣分处理。

sobereva · 发表于 Post on 2025-5-9 02:25:01

没有理由非得切换到NVT。并且说清楚“限制性”到底指什么

肉眼看轨迹，凭常识就知道接触情况是否合理。拿不准就参考固液界面研究文章里的图

例如北京科音CP2K第一性原理计算培训班（http://www.keinsci.com/KFP）将AIMD模拟的部分给了固液界面的例子，这结果就很合理：

user_fu · 发表于 Post on 2025-5-9 09:32:50

老师，限制性指的是用以两个原子之间的距离为cv来反应吸附和脱附的过程，通过lagrangemultlog文件得到他们的自由能变化，不知道这个限制性是否可以在npt里面进行

吞木木 · 发表于 Post on 2025-5-9 10:17:05

user_fu 发表于 2025-5-9 09:32
老师，限制性指的是用以两个原子之间的距离为cv来反应吸附和脱附的过程，通过lagrangemultlog文件得到他们 ...

我觉得你的问题可能比较适合使用增强采样的方法（cp2k结合plumed），你可以再多了解一下

user_fu · 发表于 Post on 2025-5-9 12:07:48

本帖最后由 user_fu 于 2025-5-9 12:13 编辑

吞木木发表于 2025-5-9 10:17
我觉得你的问题可能比较适合使用增强采样的方法（cp2k结合plumed），你可以再多了解一下

好的，因为现在用这个方法已经做了一部分了，想着用这个方法做继续做下去，换其他方法的话可能时间不允许了

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