[GROMACS] 请教“在受力条件下纤维素晶体结构变化”模拟结果的准确性？

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发表于 Post on 2025-4-14 16:57:29 | 只看该作者 Only view this author |只看大图 View big picture 回帖奖励

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如题所示，我考虑利用GROMACS模拟“纤维素晶体在加压条件下的结构变化”（为后续模拟复杂体系做准备），通过学习得到了一些模拟结果，不过不太确定其准确性，所以想向各位老师请教下，谢谢！
我主要有两块内容不太确定：
1.mdp文件里的参数设置是否合理？不合理的话，应当如何优化？
2.从直觉上来看，我模拟得到的结果准确吗？（我有些不太确定这样的模拟结果是否可靠：当加速度小于某一值时，纤维素晶体结构并没有明显变形；当加速度稍大于某一值时，纤维素分子链迅速被挤出。）
模拟中的mdp文件及模拟结果如下图所示:

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