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[其它程序] Centos7下安装GPAW报错求助

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想学习GPAWhttps://wiki.fysik.dtu.dk/gpaw/install.html#

但是Centos7环境下安装
python3 -m pip install gpaw
报错。。。折腾了好久安不上


Running setup.py install for gpaw ... error
    ERROR: Command errored out with exit status 1:
     command: /usr/local/bin/python3 -u -c 'import sys, setuptools, tokenize; sys.argv[0] = '"'"'/tmp/pip-install-va84ucw1/gpaw/setup.py'"'"'; __file__='"'"'/tmp/pip-install-va84ucw1/gpaw/setup.py'"'"';f=getattr(tokenize, '"'"'open'"'"', open)(__file__);code=f.read().replace('"'"'\r\n'"'"', '"'"'\n'"'"');f.close();exec(compile(code, __file__, '"'"'exec'"'"'))' install --record /tmp/pip-record-edh98cpa/install-record.txt --single-version-externally-managed --user --prefix= --compile --install-headers /home/ming/.local/include/python3.7m/gpaw
         cwd: /tmp/pip-install-va84ucw1/gpaw/
    Complete output (895 lines):
    which: no mpicc in (/usr/local/bin:/usr/local/sbin:/usr/bin:/usr/sbin:/bin:/sbin:/home/ming/.local/bin:/home/ming/bin)
    .git directory not found. GPAW git hash not written.


弄不清楚问题在哪里。。。
求助。。谢谢

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发表于 Post on 2020-2-9 02:54:43 | 只看该作者 Only view this author
which: no mpicc in (/usr/local/bin:/usr/local/sbin:/usr/bin:/usr/sbin:/bin:/sbin:/home/ming/.local/bin:/home/ming/bin)

应该是安装程序没找到mpicc。
或者可以试试Customizing installation的方式,然后把siteconfig.py修改成和你服务器环境一致的环境变量。

当时编译的时候倒是还算顺利,但最后做test也不是全都pass的,看看还有没有更有经验的前辈能一块交流交流。
日常打哑谜&&探寻更多可能。
原理问题不公开讨论,非商业性质讨论欢迎私聊。不做培*,不接代*,不接*发谢谢。

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发表于 Post on 2020-2-9 05:53:53 | 只看该作者 Only view this author
帖子标题末尾已经写了“求助”了就不要自己在开头再写【求助】,给你去掉了

看GPAW官网说明有没有提到兼容什么MPI库。诸如兼容OpenMPI,你就安装OpenMPI到默认路径下,然后重新编译再试
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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发表于 Post on 2020-2-9 11:19:39 | 只看该作者 Only view this author
看下GPAW文档的安装部分,需要自己配置一些路径。
17年我编译成功过,但是一直没怎么用。现在看了文档,发现配置方式已经改了,因此我的编译方式对你参考价值不大。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-2-9 17:59:08 | 只看该作者 Only view this author
卡开发发 发表于 2020-2-9 02:54
应该是安装程序没找到mpicc。
或者可以试试Customizing installation的方式,然后把siteconfig.py修改成 ...

谢谢~我这就试试

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-2-9 18:00:51 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-2-9 05:53
帖子标题末尾已经写了“求助”了就不要自己在开头再写【求助】,给你去掉了

看GPAW官网说明有没有提到兼 ...

哦哦~好的谢谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-2-9 18:01:27 | 只看该作者 Only view this author
get-it 发表于 2020-2-9 11:19
看下GPAW文档的安装部分,需要自己配置一些路径。
17年我编译成功过,但是一直没怎么用。现在看了文档,发 ...

谢谢~~我再努力一把。。。

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