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[CASTEP/Dmol3/MS] 求助 CASTEP计算拉曼光谱过程中出现communication failure

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本帖最后由 Molly_Z 于 2019-11-2 11:50 编辑

1、问题描述:用MS的CASTEP模块计算声子谱和拉曼光谱,计算两周后显示communication failure,后台查看MS和CASTEP都还在运行,CPU基本100%占用
提示错误弹窗没有保存下来,在小*虫找到一张类似的
第一次计算精度不高时计算速度比较快,声子谱用时1周,拉曼谱2天计算了一半,将精度提高一个数量级后,计算速度很慢,一共计算60个振动模的强度,平均每天出2~3个。
2、计算机配置:Intel(R)Xeon(R)E5620 双处理器 2.4GHz+ 2.4GHz,RAM 10GB,8线程并行运行。
3、想求解:通讯报错会影响计算吗?现在无法点开job log ,无法查看job状态,不知道是已经停止计算还是继续计算的。怎么处理communication failure,让程序运行状态变成running?
此外,计算速度严重降低是什么原因?精度提高导致的还是计算参数和操作错误导致的?

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发表于 Post on 2019-11-2 18:47:07 | 只看该作者 Only view this author
发帖的时候不要图省事外链其它论坛的图片,尤其是小*虫上的,应直接上传图片。不合适的回帖我已经删了

发现帖子内容内容需要变更时,如果还没有他人回复,不要通过回复进行补充,而应直接在原帖上进行编辑
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2019-11-3 09:41:09 | 只看该作者 Only view this author
通信报错不影响计算,通常情况重启程序能够恢复。我觉得速度严重降低比较可能的因素是内存已经满了,程序就开始频繁写硬盘,这时候服务器就有可能出现这种问题,此时说不定通讯的进程都没法正常运作了。
日常打哑谜&&探寻更多可能。
原理问题不公开讨论,非商业性质讨论欢迎私聊。不做培*,不接代*,不接*发谢谢。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-11-3 20:49:02 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-11-2 18:47
发帖的时候不要图省事外链其它论坛的图片,尤其是小*虫上的,应直接上传图片。不合适的回帖我已经删了

...

抱歉,给您添麻烦了。第一次发帖不太懂操作,发了之后发现没法删除,现在了解操作了不会再犯这种错误

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-11-3 20:52:53 | 只看该作者 Only view this author
卡开发发 发表于 2019-11-3 09:41
通信报错不影响计算,通常情况重启程序能够恢复。我觉得速度严重降低比较可能的因素是内存已经满了,程序就 ...

谢谢,刚自学的MS,不懂的太多,昨天担心计算已经停止继续算也是白费时间,就退出程序重启电脑,现在重新算了。

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