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利用charmm-gui建膜蛋白结构,结果有残基飘散到磷脂边缘了怎么办

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发布时间: 2025-3-7 09:48

正文摘要:

如题:利用charmm-gui建膜蛋白结构,结果有残基飘散到磷脂边缘了怎么办

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NEW12138 发表于 Post on 2025-3-7 16:19:14
wake19 发表于 2025-3-7 15:24
要不要试试优化膜系统参数,比如调整膜的横向尺寸

还有可能是charmm-gui的周期性呈现?我发现网上有其他的人也有这样的情况
NEW12138 发表于 Post on 2025-3-7 16:16:38
wake19 发表于 2025-3-7 15:24
要不要试试优化膜系统参数,比如调整膜的横向尺寸

谢谢,好像是系统的bug,我重新导入pdb文件之后生成的膜没有这个问题了
wake19 发表于 Post on 2025-3-7 15:24:39
要不要试试优化膜系统参数,比如调整膜的横向尺寸

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