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请教:可以查找相似化合物的网站或软件

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发布时间: 2019-6-29 15:25

正文摘要:

我有一个化合物dodecan-12-olide,想查一下它的相似化合物,特别是想找有相同C原子数的环,请问有什么好的方法? PubChem的Find Similar Structures感觉不太理想

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李德贤 发表于 Post on 2019-6-30 16:34:15
indec 发表于 2019-6-30 02:47
SciFinder 可以根据相似度搜索化合物。

这个是需要付费的吧?
李德贤 发表于 Post on 2019-6-30 16:32:47
liyuanhe211 发表于 2019-6-29 19:44
“相似”这个说法太模糊了,谁也不知道(包括人和程序)你想找的是在哪方面相似的东西。

(你确实说了个 ...

谢谢您的答案。
我想做的是3d-qsar,已经知道这个化合物活性很高,并且有文献猜测内酯和环结构是关键的药效团,所以想找一些带有这么大的环和内酯的化合物,测一下活性。
indec 发表于 Post on 2019-6-30 02:47:37
SciFinder 可以根据相似度搜索化合物。
liyuanhe211 发表于 Post on 2019-6-29 19:44:19
本帖最后由 liyuanhe211 于 2019-6-29 19:50 编辑

“相似”这个说法太模糊了,谁也不知道(包括人和程序)你想找的是在哪方面相似的东西。

(你确实说了个“相同碳原子数的环”,这个检索其实可以用一些数据库的检索语言实现,但着实没提供多少有用信息,可能还有误导性,例如“环十二烷”相似吗?18-冠-6相似吗?环状碳硅醚...-C-O-Si-O-...相似吗?有桥环、并环的情况是否考虑?我是想不出什么实用情况能包括这些分子。)

最好给出研究背景(例如要做个大环内酯化反应等等)或者给出尽可能多的、有代表性的哪些化合物是你认为相似的,哪些化合物不是你认为相似的。

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